CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

تعیین ترادف و جایگاه فیلوژنتیکی جدایه ای از ویروس وای سیب زمینی از مزارع فلفل استان گلستان

عنوان مقاله: تعیین ترادف و جایگاه فیلوژنتیکی جدایه ای از ویروس وای سیب زمینی از مزارع فلفل استان گلستان
شناسه ملی مقاله: NCOCA04_043
منتشر شده در چهارمین کنگره ملی کشاورزی ارگانیک و مرسوم در سال 1394
مشخصات نویسندگان مقاله:

اکرم آق ملایی - دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
سعید نصراله نژاد - دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
فروزه سادات مصطفوی نیشابوری - دانشجوی دکترا بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی زابل

خلاصه مقاله:
طبق بررسی های انجام شده در طی سال های گذشته، ویروس وای سیب زمینی به عنوان یکی از ویروس های مخرب در خانواده سولاناسه استان گلستان است، علیرغم این، وجود و ترادف آن در مزارع فلفل استان تاکنون بررسی صورت نگرفته است. به منظور تعیین توالی، جایگاه فیلوژنتیکی و نیز مقایسه توالی PVY جدا شده از فلفل در استان گلستان با تعدادی از توالی های موجود در بانک ژن، از نمونه های فلفل که دارای علائمی مشابه به PVY بودند، نمونه برداری صورت گرفت. پس از تعیین آلودگی از طریق آزمون الایزا، بخشی از پروتئین پوششی ویروس با استفاده از جفت آغازگرهای عمومی پوتی ویروس ها در واکنش RT-PCR تکثیر شد. محصول PCR پس از ترادف یابی به همراه 28 توالی PVY در دنیا با نرم افزار Clustal X همردیف سازی شده و درخت فیلوژنتیکی در نرم افزار MEGA5 به روش maximum parsimony ترسیم گردید. نتایج آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که همه توالی های PVY در 3 گروه شامل استرین های (PVY(o), PVY(c و (PVY(KTN گروه بندی شدند. جدایه دلند با جدایه های از ترکیه، فرانسه و اسپانیا که همگی دارای نژاد C می باشند و از روی میزبان فلفل جدا شده اند، با بیشترین درصد تشابه (بیش از 98 درصد) در یک گروه قرار گرفت. بنابراین می توان گفت جدایه PVY از دلند دارای نژاد C می باشد.

کلمات کلیدی:
ویروس وای سیب زمینی، فلفل، RT-PCR، آنالیز فیلوژنتیک

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/930827/