بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ساختار ژنوتیپ های مختلف مرکبات با استفاده از آغازگرهای ISSR
محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 7، شماره: 2
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 207
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PGRLU-7-2_002
تاریخ نمایه سازی: 18 خرداد 1400
چکیده مقاله:
در برنامه های اصلاحی به آگاهی از قرابت و تنوع ژنتیکی موجود در ذخایر ژرم پلاسمی نیاز است. گستردگی کشت و میزان بالای تولید مرکبات بیانگر اهمیت آن در اقتصاد جهانی است. در این تحقیق ۱۱۰ ژنوتیپ مرکبات با استفاده از ۱۲ آغازگر ISSR مورد ارزیابی قرار گرفتند. در مجموع ۱۵۴ نوار چند شکل با میانگین ۸/۱۲ آلل امتیاز دهی شد. درصد چندشکلی از ۵۷ درصد برای آغازگر ISSR۱ تا ۸۲ درصد برای آغازگر ISSR۹ متغیر بود. متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC)، میزان متوسط شاخص نشانگر (MI)، شاخص تنوع ژنی (Nei)، شاخص شانون (I) و تعداد آلل موثر (Ne) به ترتیب ۰۰۲/۰ ± ۴۸/۰، ۱۷/۱ ± ۱۴/۶، ۱۱/۰ ± ۴۲/۰، ۱۲/۰ ± ۶۱/۰ و ۲۷/۰ ± ۷۸/۱ برآورد شد. بر اساس آماره های تنوع ژنتیکی، جمعیت مورد مطالعه تنوع ژنتیکی بالایی داشت و چهار آغازگر ISSR۱۱، ISSR۹، ISSR۴ و ISSR۵ از پتانسیل بیشتری جهت تمایز ژنوتیپ ها برخوردار بودند. تجزیه خوشه ای و تجزیه ساختار به ترتیب بر اساس روش اتصال همسایگی (NJ) و روش بیزی ژنوتیپ ها را به پنج گروه و چهار زیرجمعیت تقسیم کرد. بر مبنای هر دو تجزیه، قرار گرفتن ژنوتیپ های ناشناخته با ارقام شاهد در یک گروه، فرض زمینه ژنتیکی مشترک بین این ژنوتیپ ها را تقویت نمود. در گروه بندی ژنوتیپ ها، سه گونه حقیقی پوملو (C. maxima)، ماندارین (C. reticulate) و سیترون (C. medica) در گروه های مجزا قرار گرفتند. بر اساس نتایج، علاوه بر سه گونه حقیقی، حداقل یک گونه یا جنس دیگر از خویشاوندان مرکبات در ریخته ارثی جمعیت مورد مطالعه سهم داشت. در این تحقیق اگرچه هر دو تجزیه مورد استفاده در تکمیل اطلاعات هم کارآمد بودند، اما با لحاظ نمودن میزان اختلاط ژنتیکی و اطلاعات منشا ژنوتیپ ها، شاید بتوان بر اثربخشی بیشتر تجزیه ساختار مبتنی بر مدل در ارزیابی روابط ژنتیکی دست یافت.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
ابوذر ابوذری
Crop and Horticultural Science Research Department, Mazandaran Agricultural Resources Research and Education Center, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Sari, Iran
احمد رضا دادرس
Zanjan Agricultural Resources Research and Education Center, Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
بهروز گلعین
Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
یحیی تاجور
Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :