شناسایی اعضای خانواده ژنی CBL در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis)
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 340
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
BIOCONF21_0045
تاریخ نمایه سازی: 7 شهریور 1400
چکیده مقاله:
تعیین توالی کامل ژنوم (WGS) گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis)، منابع ژنومیکی با ارزشی را جهت بررسی خصوصیات خانواده های ژنی درگیر در تنشهای مختلف غیرزیستی نظیر تنش شوری و خشکی فراهم نموده است. پروتئینهای شبه کالسینئورین (CBLs) B بعنوان یک مولکول پیام رسان ثانویه زیرخانواده گروه سنسورهای کلسیم بوده، که در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیکی و رشد و نمو گیاهان از نقشی کلیدی برخوردارند. در این تحقیق، بررسی سنسورهای کلسیم زیرخانواده CBL در دو گونه شورپسند آلوروپوس لیتورالیس و شیرینپسند آرابیدوپسیس تالیانا مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس همولوژی توالی و روابط اورتولوژی با ژنهای آرابیدوپسیس، ۶ ژن شناسایی شده در ژنوم آلوروپوس در قالب سه گروه پروتئینی AlCBL۴، AlCBL۲ و AlCBL۱۰ دسته بندی شدند. بررسی خانواده ژنی AlCBL بر مبنای همردیفی چندگانه در گیاه آلوروپوس لیتورالیس موید حضور چهار دمین EF-hand در تمام این ژنها بوده که ساختاری را برای اتصال یون کلسیم فراهم مینماید. شباهت بالای خصوصیات فیزیکوشیمیایی اکثر پروتئینهای آلوروپوس به آرابیدوپسیس و داشتن رابطه قوی اورتولوژی با یکدیگر ممکن است دلالت بر محفوظ ماندن کارکرد و عملکرد این ژنها در فرایند تکاملی بوده باشد. پروفایل بیانی متفاوت در داده های بیانی RNA-seq آلوروپوس لیتورالیس، دلیلی بر الگوی عملکردی متفاوت این ژنها بود. نتایج بدست آمده در این تحقیق میتواند اطلاعات ارزشمندی در مورد نقش این خانواده ژنی و مکانیسمهای عملکردی آنها در تحمل به تنشهای غیر زیستی برای مطالعات آتی مهیا سازد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مژده عرب
گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید نجفی زرینی
گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده
گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری ، ایران
سیدحمیدرضا هاشمی پطرودی
گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری ، ایران