بررسی عارضه اختلال در غلاف بندی سویا با رهیافت های پروتئومیک و بیوانفورماتیک
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 226
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-14-42_013
تاریخ نمایه سازی: 22 مرداد 1401
چکیده مقاله:
چکیده مبسوط
مقدمه و هدف: عارضه اختلال در غلاف بندی نوع ویژهای از رشد همراه با ناهنجاری در تشکیل گل و غلاف است که در آن گیاهان سویا مدتها پس از رسیدگی غلاف ها، سبز باقی می مانند و منجر به کاهش شدید عملکرد می گردد. به منظور بررسی و شناسایی پروتئین های دخیل در تظاهر عارضه اختلال در غلاف بندی سویا، پروفایل بیان پروتئین های گیاهان سالم و مبتلا به عارضه اختلال در غلاف بندی سویا در دو رقم کتول و گرگان ۳ بر اساس رهیافت های پروتئومیک و بیوانفورماتیک مورد مقایسه قرار گرفتند.
مواد و روش ها: برای این منظور نمونه های برگی گیاهان سالم و مبتلا از دو رقم فوق در مرحله گلدهی انتخاب و پروتئین آنها به روش TCA/Acetone استخراج شد. سپس تفکیک پروتئین ها و تجزیه افتراقی آنها به ترتیب با استفاده از ژل الکتروفورز دو بعدی و طیف سنجی جرمی nESI-LC-MS/MS انجام شد.
یافته ها: تجزیه و تحلیل نتایج ژل الکتروفورز دو بعدی نشان داد که سطح بیان ۵ تا از ۱۵۵ لکه پروتئینی در رقم کتول و ۱۱ تا از ۱۴۳ لکه پروتئینی در رقم گرگان ۳ در گیاهان سالم و مبتلا به طور معنیداری تغییر یافت. آنالیز افتراقی پروتئین ها با تغییر بیان معنی دار باnESI-LC-MS/MS نشان داد که در پاسخ به این عارضه بیشتر پروتئین های درگیر در فعالیت های تنظیم سلولی، تولید انرژی، متابولیسم، انتقال سیگنال، نسخه برداری و ترجمه ژن و نیز تقسیط و ذخیره سازی پروتئینها شرکت دارند.
نتیجه گیری: در میان پروتئین های شناسایی شده احتمالا پروتئینهای ۱۴-۳-۳ like protein، OEE۲ ، زیر واحد بزرگ رابیسکو و پروتئین NACA ممکن است از جمله تنظیم کننده های کلیدی عارضه اختلال در غلاف بندی سویا باشند.
کلیدواژه ها:
Cell proteolysis ، Green-stay phenotype ، Mass spectrometery ، Rubisco ، Soybean proteome ، Two dimentional gel electrophoresis ، پروتئوم سویا ، پروتئولیز سلولی ، رابیسکو ، ژل الکتروفورز دو بعدی ، طیف سنجی جرمی ، فنوتیپ سبز
نویسندگان
کمال پیغام زاده
Agricultural Research, Education and Extension Organization
محمود تورچی
University of Tabriz
زهرا سادات شبر
Agricultural Research, Education and Extension Organization
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :