تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی دو جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و بررسی جایگاه فیلوژنتیکی آنها

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 163

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-6-1_003

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

چکیده ویروس موزاییک هندوانه (WMV) Watermelon mosaic virusمتعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae از ویروس‎‎های مهم آلوده کننده کدوئیان در دنیا محسوب می­شود. دو جدایه این ویروس به نام‎های YAZ.WMV.۴۱ و YAZ.WMV.۵۵ از مزارع خیار و طالبی استان یزد جمع‎آوری گردید. آلودگی نمونه‎ها با آزمون سرولوژیکی الایزای مستقیم و غیرمستقیم و آنتی بادی پلی کلونال این ویروس بررسی شد. این دو جدایه در مقابل آنتی‎بادی واکنش نشان ندادند. در بررسی علائم این جدایه‎ها برروی گیاهان آزمون کدوی مراغه، لوبیا چیتی و لوبیا چشم بلبلی، علائم متفاوتی با آنچه تا کنون در مورد جدایه‎های این ویروس گزارش شده، مشاهده گردید. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی قطعه­ای به طول ۸۰۹ جفت باز از ژن پروتئین پوششی تکثیر و تعیین ترادف شد. مقایسه­ی ترادف های بدست آمده در این تحقیق با ترادف های موجود در بانک جهانی ژن نشان داد که جدایه‎های مورد مطالعه به همراه یک جدایه­ی ایرانی (رس شمار EU۶۶۷۶۲۷) با دامنه­ی میزبانی متفاوت، در زیر گروه IIB قرار می‎گیرند. سایر جدایه‎های ایرانی گزارش شده قبلی در گروه‎های I و AII قرار گرفتند. مقایسه­ی میزان تشابه اسید نوکلئیک این جدایه‎ها با یکدیگر نشان داد که جدایه‎های ایرانی مربوط به این مطالعه بیشترین و کمترین میزان شباهت را با جدایه‎های کشورهای اسپانیا (رس شمار AJ۵۷۹۵۱۸) و ایران (رس شمار GQ۴۲۱۱۶۱) به ترتیب به میزان ۵/۹۹ و ۲/۹۲ درصد دارا می باشند. نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر این است که کدوئیاندر مزارع وگلخانه‎های ایران بوسیله جدایه‎های متعدد این ویروس آلوده می شوند.

کلیدواژه ها:

الایزا ، کدوئیان ، واکنش زنجیره ای پلیمراز ، ویروس موزائیک هندوانه

نویسندگان

حسین معصومی

استاد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر.

فاطمه محمدی پاقلعه

دانشجوی سابق کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.

خدیجه سالاری

مربی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت.

جهانگیر حیدرنژاد

دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.

اکبر حسینی پور

دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • سمیعی ا، ۱۳۸۳. شناسائی، تعیین پراکنش و بررسی برخی خصوصیات ...
  • ابراهیم نسبت ف، ۱۳۵۱. گزارشی درباره جدا کردن ویروس موزائیک ...
  • Abou-Jawadah Y, Sobh H, EL-Zammar S, Fayyad A, and Lecoq ...
  • Clark MF and Adams SA N, ۱۹۷۷. Characteristics of microplates ...
  • Hall TA, ۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Lecoq H, Desbiez C and Delecolle B, ۲۰۰۸. Cytological and ...
  • Massumi H, Samei A, Hosseini-Pour A, Shabanian M and Rahimian ...
  • Moreno IM, Malpica JM, Diaz-Pendon JA, Moriones E, Fraile A ...
  • Muhire BM, Varsani A and Martin DP, ۲۰۱۴. SDT: A ...
  • Nagel H and Hiebert F, ۱۹۸۵. Structure of Watermelon mosaic ...
  • Purcifull DE, Heibert E and Edwarson J,۱۹۸۴. Watermelon mosaic virus-۲. ...
  • Rahimian H and Izadpanah K, ۱۹۸۷. Identity and prevalence of ...
  • Rozas J, Snchez-DelBarrio JC, Messeguer X and Rozas R, ۲۰۰۳. ...
  • Shoeibi S, Masumi M, Nasrollahnezhad S, Heydari S, Izadpanah K ...
  • Sharifi M, Massumi H, Heydarnejad J, Hosseinipour A, Shabanian M ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M ...
  • Van Regenmortel MH, ۱۹۶۰. Zone electrophoresis and electron microscopy of ...
  • Zhang JX and Yangfeng WU, ۲۰۰۹. Complete nucleotide sequence of ...
  • Zitter TA, Hopkins DL and Thomas C E, ۱۹۹۶. Compendium ...
  • نمایش کامل مراجع