مطالعه فیلوژنتیکی ژنهای مقاوم به بیماری و مطالعه عملکردی ژن RLM1 در Arabidopsis thaliana با ابزارهای بیوانفورماتیکی

با وجود پیشرفتهای چشمگیر در استراتژی های کنترل بیماریهای گیاهی، اما همچنان تعداد زیادی از پاتوژنها و آفات خسارت زیادی وارد می کنند. با مقایسه توالیهای اسید آمینه های پروتئینهای رمز شده توسط ژنهای مقاومت در گیاهان با منشاء تکاملی مختلف مشخص شده است که ژنهای مقاومت بر اساس مشابهتهای ساختاری تولیدت پروتئین به گروه های CC-NBS-LRR-LRR, TIR-NBS-LRR خارج سلولی LRR kinase و گیرنده کینازی طبقه بندی می شوند. در این تحقیق با بررسی توالی پروتئینی ژنهای مقاومت در گیاهان مختلف، روابط تکاملی و نحوه ارتباط آنها با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی تعیین شد. نتایج تجزیه کلاستر مشخص نمود توالی پروتئینی این ژنها در سه گروه قرار دارند گیاه آرابید و پسیس که دارای ژن مقاومت Rlm1 در گروه جداگانه ای قرار دارد. نتایج ماتریس تکاملی نشان داد که بیشترین فاصله (0/99) بین گیاه Populus trichocarpa و Solanum lycopersicum کمترین فاصله (0/287) بین Solanum lycopersicum و Vitis vinifera می باشد. نتایج همردیفی پروتئین های مشخص نمود که ژنهای مقاومت از هم دور هستند و از یک منشاء مشابه نیستند. نتایج عملکردی Rlm1 در گیاه آرابیدوپسیس نشان داد که این ژن بر روی کروموزوم 1 قرار دارد و با متحد شدن با سیگنالهای داخل سلولی یا خارج سلولی در انتقال سیگنالها از یک قسمت غشا به قسمت دیگر فعالیت می کند.

کلیدواژه ها:

ژن های مقاومت ، تجزیه کلاستر ، آنالیز فیلوژنتیکی