طراحی الگوریتمی جهت استخراج ORF ها درژنوم های پروکاریوتی
محل انتشار: چهاردهمین کنفرانس مهندسی برق ایران
سال انتشار: 1385
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,191
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICEE14_015
تاریخ نمایه سازی: 25 تیر 1387
چکیده مقاله:
این الگوریتم پس از استخراج تمام orf های موجود. Orf های غیر همپوشان طولانی تر از یک سطح آستانه را که توسط کاربر تعیین می شود، را از بین orf های استخراج شد ه ، جدا میکند . الگوریتم پیشنهادی را به زبا ن ++C کدکرده و سپس آنرا بر روی ژنوم Ecoli آزمایش نموده و نتیجه با نرم افزار Glimmer مقایسه شده است و مشاهده شدکه روش ارائه شده در یافتن orf های بلندغیر همپ وشان دارای دقت بیشتری نسبت به Glimmer است . در آزمایش دیگر ازاطلاعات ارائه شده در GenBank استفاده شد و مشاهده شد که نزدیک به 90 درصد از orf های بلند غیر همپوشان بدست آمده ژن هستند. ازکاربردهای عمده این طرح یافتن orf ها بعنوان نامزدهای اولیه ژن و همچنین گرد آ وری اطلاعات لازم برای تعلیم الگوریتمهای یادگیری ماشینی به صورت خودآموز جهت انتخاب دقیق موقعیت ژنها است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رحیم ملکشاهی
دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان – دانشکده پزشکی - گر
علیرضا مهری دهنوی
استادیار دانشگاه علوم پزشکی اصفهان
مجید بیگی
دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک ( Tuebingen)
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :