مقایسه بیوانفورماتیکی سایت های فعال آنزیم بتا 1 و 4 اندوگلوکاناز در دو ایزوله دارای فعالیت بالا و پائین سلولازی Trichoderma longibrachiatum

در این پژوهش در ابتدا با توجه به غربالگری انجام شده بر روی ایزوله های قارچ های خاکزاد در محیط القاء تولید آنزیم سلولاز، میزان فعالیت آنزیمی هر یک مشخص گردید. از بین این ایزوله ها، تعدادی دارای فعالیت بالای سلولازی و تعدادی دارای فعالیت تولید سلولاز پائین بودند. از بین قارچهای با تولید سلولاز بالا، قارچ Trichoderma longibrachiatum با فعالیت بسیار بالای سلولازی و از بین قارچهای با تولید سلولاز پائین یک جدایه قارچ از همین گونه انتخاب و با توجه به پروفایل پروتئینی و حضور آنزیم اندوگلوکاناز با وزن مولکولی 50 کیلودالتون، cds ژن بتا 1 و 4 اندوگلوکاناز استخراج، تکثیر و سپس تعیین توالی شد. آنالیزهای بیوانفورماتیکی بر روی توالی نوکلوئیدی و پروتئینی انجام گردید. ایزوله ی با تولید سلولاز بالا دارای یک پروسایت بیشتر با نام CBM1 (carbohydrate binding type-1) domain signature می باشد که با قارچ با تولید سلولاز پائین این سایت را دارا نیست. سپس این سایت، در سایر موجوداتی که اطلاعات آنها تا کنون به دست آمده است ردیابی شد. در رابطه با این سایت یک نمونه ویروس هم معرفی شده است. این ویروس با نام (Ectocarpus siliculosus virus 1(EsV-1 که از جنس Phaeovirus و دارای ژنوم dsDNA می باشد، بر روی یک نوع جلبک به نام Ectocarpus siliculosus ایجاد بیماری می کند. بیماریزا نبودن این ویروس برای انسان و ساده تر بودن ژنوم ویروس ها به نسبت قارچها می توان یک نکته مثبت و راهگشا برای استفاده آن در صنعت باشد.

کلیدواژه ها:

فعالیت سلولازی ، Trichoderma longibrachiatum ، سایت های پروتئینی