آنالیز تفاوت ژنتیکی ژن های مرتبط با پاسخ ایمنی بین گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 327
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_RAP-12-31_015
تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400
چکیده مقاله:
جهش در طول توالی ژنها سبب بروز تغییرات نوکلئوتیدی و درنتیجه ایجاد عملکرد جدید در ژنها میشود. هدف از مطالعه حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی و تحلیل بیان متفاوت ژن های مرتبط با سیستم ایمنی در بین دو جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد بود. در این مطالعه از نتایج مربوط به آنالیز بیان افتراقی در بین جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq جهت تجزیه ژنتیکی و ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده شد. توالیهای نوکلئوتیدی با روش ClustalW توسط نرم افزار MegaAlign همردیف سازی شدند و درخت فیلوژنتیکی و ماتریس تفاوت و تشابه توالیها ترسیم شد. بر اساس نتایج این تحقیق، میانگین اختلاف نوکلئوتیدها و تعداد کل جهشها برای ژن های مورد مطالعه در بین جمعیت های گاو نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد بهترتیب در محدودهی (۲۵۹۸/۶۶-۱۸۶) و (۳۸۹۸-۷۴) قرار داشت. همچنین، نواحی حفاظت شده بخش اندکی از توالی ژنهای مورد مطالعه را تشکیل دادند که این امر نشان دهنده چند شکلی بالای این ژنها و همچنین مستعد بودن به تغییرات نوکلئوتیدی و جهش میباشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنی توالی نوکلئوتیدی ژنهای مورد مطالعه نشان داد که تنوع ژنتیکی و واگرایی برای ژنهای مورد مطالعه در بین جمعیتهای گاو نژاد خالص، آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد و ایندیکوس وجود دارد. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS برای ژنهای مورد مطالعه نشان دهنده انتخاب مثبت این ژنها بود.
کلیدواژه ها:
Evolution ، Genetic diversity ، Mutations ، Phylogenetic ، Sistani cows ، تکامل ، تنوع ژنتیکی ، جهش ، فیلوژنتیک ، گاو سیستانی
نویسندگان
بتول اصغری اسفدن
University of Zabol
غلامرضا داشاب
University of Zabol
محمد حسین بنابازی
Department of Biotechnology, Animal Science Research Institute of IRAN (ASIR)
محمد رکوعی
University of Zabol
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :