شناسائی مولکولی و آنالیز فیلوژنی زوانتارین ها براساس نشانگر ITS- rDNA در جزیره لارک، خلیج فارس

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 185

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-9-2_033

تاریخ نمایه سازی: 17 آبان 1400

چکیده مقاله:

راسته Zoantharia (Zoantharian) یکی از راسته­ های بسترزی شاخه گزنه ­سانان (Cnidarian) می­ باشد که پراکنش وسیعی در مناطق آبسنگی خلیج ­فارس دارند. مطالعه حاضر  اولین بررسی تنوع زیستی این راسته با استفاده از نشانگر هسته ­ای (ITS- rDNA) در خلیج­ فارس  می ­باشد. بدین منظور پانزده کلنی جمع ­آوری شده از جزیره لارک از آزمایشگاه بیولوژی دریا واحد علوم و تحقیقات تهران تهیه شد. DNA نمونه­ ها با استفاده از کیت Bio Basic INC استخراج شد. سپس واکنش زنجیره ­ای پلی مراز با استفاده از آغازگر­های اختصاصی زوانتارین جهت تکثیر قطعه ژنی ITS- rDNA انجام شده و محصولات به ­دست آمده توالی ­یابی شدند. داده ­ها با استفاده از نرم­ افزارهای  MEGA۵ و MrBayes آنالیز شدند. نتایج بررسی فیلوژنی توالی­ های به ­دست آمده از نشانگر هسته­ ای حاکی از وجود سه گونه Zoanthus sansibaricus، Palythoa aff. mutukiوPalythoa tuberculosa در این منطقه می­ باشد که بررسی پیشین با استفاده از نشانگر میتوکندریایی را تایید کرد. از آن­ جایی­ که ITS کپی­ های متعدد اینتراژنومیک دارد و در نتیجه دارای تنوع بالایی می­ باشد، برخلاف نشانگرهای میتوکندریایی نمی­ توان به ­عنوان DNA barcode استفاده شود ولی استفاده از آن به یقین می ­تواند در تایید صحت اطلاعات به­ دست آمده از نشانگرهای میتوکندریایی بسیار کارآمد باشد.  توالی ­های به ­دست آمده از نمونه­ های خلیج ­فارس تفاوت قابل ملاحظه­ ای با توالی­ های نمونه ­های مشابه در سایر مناطق جهان داشتند. در این راستا بایستی تاثیر شرایط اکولوژیک خلیج­ فارس بر جهش ژنی در زوانتارین­ ها بررسی گردد.

کلیدواژه ها:

ITS-rDNA ، زوانتارین ، Zoanthus sansibaricus ، Palythoa aff. mutuki و Palythoa tuberculosa

نویسندگان

معصومه ولیزاده تالارپشتی

گروه زیست شناسی، واحد تهران شرق، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

الهه علی عسگری

گروه زیست شناسی، واحد تهران شرق، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

آتوسا نوری کوپائی

گروه زیست شناسی دریا، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم وتحقیقات تهران، تهران، ایران