تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیکی ناحیه تنظیمی بالادستی ژن های لپتین و SIGLEC۵ در ارتباط با صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاوهای هلشتاین

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 117

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARGU-8-3_007

تاریخ نمایه سازی: 27 بهمن 1401

چکیده مقاله:

هدف از پژوهش حاضر تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیکی ناحیه تنظیمی بالادستی ژن­های لپتین و SIGLEC۵ در ارتباط با صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاو­های هلشتاین استان مازندران بود. بدین منظور تعداد ۳۰۰ نمونه خون به طور تصادفی تهیه و استخراج DNA انجام شد. سپس دو قطعه ۲۵۲ و ۴۰۶ جفت بازی به ترتیب از ناحیه تنظیمی بالادست ژن­های لپتین و SIGLEC۵ با PCR تکثیر و تعیین ژنوتیپ­ها با روش SSCP انجام شد. از هر الگوی باندی یک نمونه توالی­یابی شده و بررسی­های بیوانفورماتیک با نرم افزارهای BioEdit و DNASIS MAX انجام شد. جایگاه SIGLEC۵ در این پژوهش تک شکل بود، اما در جایگاه لپتین چهار الگوی باندی A، B، C و D به ترتیب با فراوانی­های ۲۵/۰، ۳۶/۰، ۲۲/۰ و ۱۷/۰ مشاهده شدند. بررسی آماری نشان داد که چندشکلی­های ژن لپتین با صفت چربی شیر و وضعیت زایش ارتباط معنی­دار دارد (۰۵/۰>p )، به طوری که افراد دارای الگوی باندی A بیشترین چربی شیر و افراد دارای الگوی باندی D کمترین چربی شیر را نشان دادند. همچنین افراد دارای الگوی باندی D دارای بهترین وضعیت زایش (طبیعی) بودند (۰۵/۰>p ). بررسی­های بیوانفورماتیکی به ترتیب وجود ۱۴ و نه موتیف را در ژن­های SIGLEC۵ و لپتین نشان دادند. لذا، بر اساس نتایج این پژوهش، استفاده از ژن لپتین برای بهبود صفات تولیدی و تولیدمثلی پیشنهاد می­شود. علاوه بر آن، انجام مطالعات تکمیلی روی سایر نواحی ژن SIGLEC۵ در ارتباط با صفات تولیدمثلی و تولیدی در گاو هلشتاین اکیدا توصیه می­شود.

نویسندگان

مریم حسین پور کل محله

فارغ التحصیل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

ایوب فرهادی

استادیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قدرت رحیمی میانجی

استاد گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

محسن قلی زاده

استادیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Angata T., Margulies E. H., Green E. D. and Varki ...
  • Avril T., Freeman S. D., Attrill H., Clarke R. G. ...
  • Clempson A. M., Pollott G. E., Brickell J. S., Bourne ...
  • Cole J. B., VanRaden P. M., O’Connell J. R., Van ...
  • D’haeseleer P. ۲۰۰۶. What are DNA sequence motifs? Nature Biotechnology, ...
  • Elmac C., Sahin S. and Oner Y. ۲۰۱۳. Distribution of ...
  • Hinuy H. M., Hirata M. H., Forti N., Diament J., ...
  • Lawlor T. J., VanRaden P.M., Null D., Levisee J. and ...
  • Leblanc S. J. ۲۰۱۳. Is a high level of milk ...
  • Magni P., Motta M. and Martini L. ۲۰۰۰. Leptin: a ...
  • Mason M. M., He Y., Chen H., Quon M. J. ...
  • Melzner I., Scott V., Dorsch K., Fischer P., Wabitsch M., ...
  • Miller S. G., De Vos P., Guerre-Millo M., Wong K., ...
  • Mounzih K., Qiu J., Ewart-Toland A. and Chehab F. F. ...
  • Patel N., Brinkman-Van der Linden E. C., Altmann S. W., ...
  • Varki A. ۲۰۰۹. Natural ligands for CD۳۳-related Siglecs? Glycobiology, ۱۹(۸): ۸۱۰-۸۱۲. Yoon ...
  • Zhang Y., Proenca R., Maffei M., Barone M., Leopold L. ...
  • نمایش کامل مراجع