واکنش زنجیره ای پلیمراز- چند شکلی طول قطعه محدود (PCR-RFLP)؛ متد سریع و ساده در تشخیص قارچ های بیماری زا

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 108

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JMUMS-33-225_023

تاریخ نمایه سازی: 29 مهر 1402

چکیده مقاله:

در سال های اخیر، بروز عفونت های ناشی از قارچ های بیماری زا در سطح جهانی افزایش یافته است، به ویژه در بیماران مبتلا به نقص ایمنی، بیماران پیوندی و یا بیمارانی که تحت شیمی درمانی در بخش های مراقبت های ویژه قرار می گیرند. با توجه به موربیدیتی و گسترش سریع عفونت به سایر اندام ها، تشخیص دقیق، سریع و درمان عفونت های قارچی امری ضروری است. روش های مولکولی از جمله polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism دارای برتری قابل توجهی در حساسیت و ویژگی نسبت به روش های مرسوم است. هدف از این مطالعه اشاره به محدودیت های روش های تشخیصی متداول و عوامل موثر بر حساسیت و ویژگی تست تشخیصی مولکولی PCR-RFLP است. در این مطالعه مروری، مطالب علمی مرتبط با موضوع، شامل جستجوی کلید واژه های قارچ های بیماری زا، روش های تشخیصی مولکولی RFLP، در بانک های اطلاعاتی فارسی و هم چنین جستجو در سایر بانک های الکترونیکی لاتین مشتمل بر Scopus، Web of science و PubMed تا سال ۲۰۲۳ جمع آوری و مورد مطالعه قرار گرفت. با بررسی مقالات متعدد دیده شد که روش RFLP-PCR سریع، عملی و قابل اعتماد است و می تواند در آزمایشگاه ها در تعیین گونه های قارچی جداشده از نمونه های بالینی استفاده شود. از جمله معایب PCR-RFLP، تعیین دقیق پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در یک مکان تشخیصی خاص است.

کلیدواژه ها:

RFLP ، molecular diagnostic technique ، fungi ، قارچ های بیماری زا ، روش های تشخیصی مولکولی ، PCR-RFLP

نویسندگان

رباب ابراهیمی باروق

PhD Student, Student Research Committee, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran

ایمان حقانی

Assistant Professor, Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran

جواد جاویدنیا

PhD in Medical Mycology, Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran

مهدی عباس تبار

Associate Professor, Department of Medical Mycology, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran and Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Pathakumari B, Liang G, Liu W. Immune defence to invasive ...
  • Sharma B, Nonzom S. Superficial mycoses ...
  • a matter of concern: Global and Indian scenario‐an updated analysis. ...
  • Guégan S, Lanternier F, Rouzaud C, Dupin N, Lortholary O. ...
  • Brown GD, Denning DW, Gow NA, Levitz SM, Netea MG, ...
  • Khodavaisy S, Mahmoudi S, Agha Kuchak Afshari S, Salehi Z, ...
  • Khan S, Farabi B, Navarrete-Dechent C, Rao B, Safai B. ...
  • Sadamoto S, Mitsui Y, Nihonyanagi Y, Amemiya K, Shinozaki M, ...
  • Moallemzadeh SA, Yadegari MH, Rajabi Bazl M, Kachuei R. The ...
  • Jensen RH, Arendrup MC. Molecular diagnosis of dermatophyte infections. Curr ...
  • Lamont RF, van den Munckhof EH, Luef BM, Vinter CA, ...
  • Fatahi M, Shokohi T, Sooteh H, Hedayati M, Okhovatian A, ...
  • Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW. Construction of ...
  • Hashim HO, Al-Shuhaib MBS. Exploring the potential and limitations of ...
  • Wolf C, Rentsch J, Hübner P. PCR− RFLP analysis of ...
  • Kisiala M, Kowalska M, Pastor M, Korza HJ, Czapinska H, ...
  • Miljkovic M, Malesevic M, Filipic B, Vukotic G, Kojic M. ...
  • Yang ZH, Huang JX, Yao YJ. Autoscreening of restriction endonucleases ...
  • Jenkins G, Suzen H, Sueiro R, Parry J. The restriction ...
  • Chaudhary R, Kumar G. Restriction fragment length polymorphism. Encyclopedia of ...
  • Kupsch C, Ohst T, Pankewitz F, Nenoff P, Uhrlaß S, ...
  • de Hoog GS, Dukik K, Monod M, Packeu A, Stubbe ...
  • Gordon AK, McIver C, Kim M, Murrell DF, Taylor P. ...
  • Abastabar M, Jedi A, Guillot J, Ilkit M, Eidi S, ...
  • Hainer BL. Dermatophyte infections. Am Fam Physician ۲۰۰۳; ۶۷(۱): ۱۰۱-۱۰۸ ...
  • De Baere T, Summerbell R, Theelen B, Boekhout T, Vaneechoutte ...
  • Rezaei-Matehkolaei A, Makimura K, Shidfar M, Zaini F, Eshraghian M, ...
  • Abastabar M, Mirhendi H, Rezaei-Matehkolaei A, Shidfar MR, Kordbacheh P, ...
  • Rodrigues AM, Della Terra PP, Gremião ID, Pereira SA, Orofino-Costa ...
  • Cruz Choappa RM, Vieille Oyarzo PI, Carvajal Silva LC. Isolation ...
  • Boechat JS, Oliveira MME, Gremião IDF, Almeida-Paes R, Machado ACdS, ...
  • Kawasaki M, Anzawa K, Mochizuki T, Ishizaki H. New strain ...
  • Ishizaki H, Kawasaki M, Anzawa K, Mochizuki T, Chakrabarti A, ...
  • Montenegro H, Rodrigues AM, Dias MAG, da Silva EA, Bernardi ...
  • Rodrigues AM, de Hoog GS, de Camargo ZP. Genotyping species ...
  • Rodrigues AM, Gonçalves SS, de Carvalho JA, Borba-Santos LP, Rozental ...
  • Rodrigues AM, Orofino-Costa R, de Camargo ZP. Pocket guide to ...
  • Slater GSC, Birney E. Automated generation of heuristics for biological ...
  • Udagawa S. Neosartorya hiratsukae, a new species of food-borne Ascomycetes. ...
  • Geiser D, Klich M, Frisvad JC, Peterson S, Varga J, ...
  • Balajee S, Houbraken J, Verweij P, Hong S, Yaghuchi T, ...
  • Abastabar M, Hosseini T, Valadan R, Lagzian M, Haghani I, ...
  • Samson RA, Visagie CM, Houbraken J, Hong SB, Hubka V, ...
  • Nasri T, Hedayati MT, Abastabar M, Pasqualotto AC, Armaki MT, ...
  • Rudramurthy SM, Paul RA, Chakrabarti A, Mouton JW, Meis JF. ...
  • Navale V, Vamkudoth KR, Ajmera S, Dhuri V. Aspergillus derived ...
  • Schwetz I, Horina J, Buzina W, Roob J, Olschewski H, ...
  • Abastabar M, Shabanzadeh S, Valadan R, Mayahi S, Haghani I, ...
  • Chakrabarti A, Das A, Mandal J, Shivaprakash M, George VK, ...
  • Lackner M, Caramalho R, Lass-Flörl C. Laboratory diagnosis of mucormycosis: ...
  • Cornely OA, Alastruey-Izquierdo A, Arenz D, Chen SC, Dannaoui E, ...
  • Skiada A, Lass-Floerl C, Klimko N, Ibrahim A, Roilides E, ...
  • Lass-Flörl C, Mayr A. Diagnosing invasive fungal diseases–limitations of microbiological ...
  • Zaman K, Rudramurthy SM, Das A, Panda N, Honnavar P, ...
  • Kachuei R, Yadegari MH, Safaie N, Ghiasian A, Noorbakhsh F, ...
  • Nucci M, Anaissie E. Fusarium infections in immunocompromised patients. Clin ...
  • Amadasi S, Pelliccioli GF, Colombini P, Bonomini A, Farina C, ...
  • Abastabar M, Haghani I, Shokohi T, Hedayati MT, Aghili SR, ...
  • Van Diepeningen AD, Al-Hatmi AM, Brankovics B, de Hoog GS. ...
  • Salah H, Al-Hatmi AM, Theelen B, Abukamar M, Hashim S, ...
  • Nucci M, Barreiros G, Akiti T, Anaissie E, Nouér SA. ...
  • Van Diepeningen AD, Brankovics B, Iltes J, Van der Lee ...
  • Zarrin M, Ganj F, Faramarzi S. Analysis of the rDNA ...
  • chain reaction-restriction fragment length polymorphism. Biomedical Reports ۲۰۱۶; ۴(۴): ۴۷۱-۴۷۴ ...
  • Mirete S, Patiño B, Jurado M, Vázquez C, González-Jaén MT. ...
  • O'Donnell K, Sutton DA, Fothergill A, McCarthy D, Rinaldi MG, ...
  • Balajee S, Borman A, Brandt M, Cano J, Cuenca-Estrella M, ...
  • Nosratabadi M, Kachuei R, Rezaie S, Harchegani AB. Beta-tubulin gene ...
  • Mirhendi H, Ghiasian A, Vismer H, ASGARI M, Jalalizand N, ...
  • Hennequin C, Abachin E, Symoens F, Lavarde V, Reboux G, ...
  • Sadrossadati SZ, Ghahri M, Fooladi AAI, Sayyahfar S, Beyraghi S, ...
  • Ambaraghassi G, Dufresne PJ, Dufresne SF, Vallières É, Muñoz JF, ...
  • Brilhante RSN, Sales JA, da Silva MLQ, de Oliveira JS, ...
  • Ortiz B, Pérez-Alemán E, Galo C, Fontecha G. Molecular identification ...
  • Bineshian F, Yadegari MH, Sharifi Z, Eidgahi MA, Nasr R. ...
  • Hazirolan G, Altun H, Gumral R, Gursoy N, Otlu B, ...
  • Hu Y, Yu A, Chen X, Wang G, Feng X. ...
  • Romeo O, Criseo G. Molecular epidemiology of Candida albicans and ...
  • Fontecha G, Montes K, Ortiz B, Galindo C, Braham S. ...
  • Sasani E, Rafat Z, Ashrafi K, Salimi Y, Zandi M, ...
  • Pakshir K, Yazdani M, Kimiaghalam R. Etiology of vaginal candidiasis ...
  • Azar MM, Malo J, Hage CA. Endemic fungi presenting as ...
  • Rautemaa-Richardson R, Richardson MD. Systemic fungal infections. Medicine ۲۰۱۷; ۴۵(۱۲): ...
  • Wickes BL, Wiederhold NP. Molecular diagnostics in medical mycology. Nature ...
  • Szekely J, Chelae S, Ingviya N, Rukchang W, Auepemkiate S, ...
  • Roberto TN, Rodrigues AM, Hahn RC, de Camargo ZP. Identifying ...
  • Zimmermann CR, Snedker CJ, Pappagianis D. Characterization of Coccidioides immitis ...
  • Jung HJ, Kim SY, Jung JW, Park HJ, Lee YW, ...
  • Villanueva da Fonseca LA, Santos Araújo MA, Wanderlei Silva DM, ...
  • Elavarashi E, Kindo AJ, Kalyani J. Optimization of PCR—RFLP directly ...
  • Endrawati D, Kusumaningtyas E. Molecular profile of Trichophyton mentagrophytes and ...
  • Salehi Z, Shams-Ghahfarokhi M, Razzaghi-Abyaneh M. Internal Transcribed Spacer rDNA ...
  • Batvandi A, Pchelin IM, Kiasat N, Kharazi M, Mohammadi R, ...
  • Ahmad AM. Identification of Dermatophyte Species by PCR Restriction Fragment ...
  • Mochizuki H, Anzawa K, Mochizuki T. Genotyping of intraspecies polymorphisms ...
  • Çulha G, DoĞramaci AÇ, Hakverdi S, SeÇİntİ İE, AslantaŞ Ö, ...
  • Moudgal S, Rao SO, Pai MO. Mucormycosis: A comparative update ...
  • Hafez M, Abdelmagid A, Adam LR, Daayf F. Specific detection ...
  • Kim JS, Kang NJ, Kwak YS, Lee C. Investigation of ...
  • Moazeni M, Nabili M. Identification of Candida Species Isolated from ...
  • Shirvani F, Fattahi M. Molecular identification of Candida species isolated ...
  • نمایش کامل مراجع