بررسی تفاوت بیان ژنها تحت تنش خشکی در ریشه و برگ گیاه سویا از طریق دادههای ESTs با استفاده از Digital Differential Display
محل انتشار: اولین همایش ملی تنش های گیاهی غیر زیستی
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 609
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NCPAS01_045
تاریخ نمایه سازی: 27 فروردین 1393
چکیده مقاله:
سویا یکی از دانههای روغنی مهم در دنیا میباشد، همچنین منبع عمده پروتیین خوراکی است. عملکرد سویا تحت تنش خشکی به شدت کاهش مییابد. بررسیهای ژنتیکی و مطالعه بیان ژنوم، تشخیص ژنهای کلیدی که تحمل به خشکی را تنظیم مینمایند امکانپذیر میسازد. در این مطالعه به بررسی ژنهایdownregulate و upregulateشده تحت تنش خشکی در گیاه سویا رقم Williams 82 با استفاده از داده هایESTsبه کمک روشDDD در برگ و ریشه پرداخته شد. بدین منظور یک کتابخانهEST مربوط به تنش خشکی در برگ، یک کتابخانهESTمربوط به حالت نرمال در برگ، یک کتابخانهESTمربوط به تنش خشکی در ریشه و یک کتابخانهESTمربوط حالت نرمال در ریشه با یکدیگر مقایسه شدند. نتایج نشان داد ژنهایی مانند 28 kDa protein Dehydrin-like - Sieve element occlusion s (SEOS) -Maturation-associated protein (MAT9) - (VSPA) -Lectin (LOC732576), mRNA - Probable glutathione S-transferase (HSP26-A)- protein (LOC547842وMaturation polypeptide (GMPM و ( 1 Maturation-associated protein (MAT1) در برگ هنگام تنش خشکیupregulatشدند در حالیکه ژنهایCalvin cycle protein CP12-like -Chlorophyll a/b-binding protein (cab3وMetallothionein type 1 (MET1) -(LOC100814289در برگ هنگام تنش خشکیdownregulate شدند. در ریشه ژنهای Transcribed locus, strongly similar to XP_003533862.1 -Chlorophyll a/b-binding protein (cab3وLipoxygenase -PREDICTED: repetitive proline-rich cell wall protein 1-like isoform 1 [Glycine max] Sali5-4a protein - Sali3-2 (LOC547898) - Hydroxyproline-rich glycoprotein (sbHRGP2) -(LOC547836وdownregulate PIP2,2 (LOC و ( 732581 (sali5-4a شدند و هیچ ژنی نبود که در هنگام تنش خشکی در ریشهupregulate شده باشد.
کلیدواژه ها:
سویا- تنش خشکی/Digital Differential Display
نویسندگان
فرشته بیات
استادیار گروه اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه خلیج فارس،
میترا وندا
دانشجوی دکتری اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد،
اسماعیل ابراهیمی
استادیاربخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :