مقاله علمی – پژوهشی: بررسی مولکولی کوی هرپس ویروس (Koi Herpesvirus) در تلفات مزارع پرورشی ماهیان گرمابی استان خوزستان

هرپس ویروس نوع ۳ (CyHV-۳)، عامل اصلی بیماری واگیردار کوی هرپس ویروس (KHVD) در ماهی کپور معمولی و کوی در سرتاسر جهان است. بدین منظور از ۶۰ قطعه ماهی کپور معمولی از مزارع تلفات دار و مزارع استان خوزستان که در چند سال اخیر تلفات گزارش کرده بودند، طی سال های ۱۴۰۰-۱۳۹۶، جهت ردیابی بیماری ویروس هرپس کوی به روش مولکولی نمونه برداری شد. جهت افزایش بار ویروس در بافت های آبشش و کلیه، به ازای سه ماهی، سه نمونه آبشش و سه نمونه کلیه به صورت جداگانه با یکدیگر مخلوط شدند. استخراج DNA بافت با استفاده از کیت تجاری شرکت رهازیست پادتن[۱] طبق دستورالعمل کیت انجام شد. سپس آزمایش واکنش زنجیره ای پلی مراز آشیانه ای[۲] با استفاده از مسترمیکس Amplicon و پرایمرهای مربوط به ژن پلی مراز انجام شد. نتایج حاصل از Nested PCR نشان داد که ۳ نمونه (دو نمونه آبشش و یک نمونه بافت کلیه) از ۴۰ نمونه مخلوط شده مورد آزمایش دارای باند ۳۳۹ کیلوجفت باز بودند و به عنوان نمونه مثبت در نظر گرفته شدند. تعیین توالی محصولات PCR و آنالیز اولیه Blast نشان داد که توالی یکی از نمونه های مثبت به توالی های مربوط به CyHV-۳ شباهت داشت. نتایج هم ترازی ردیف های نوکلئوتیدی و درخت فیلوژنی این توالی، کوی هرپس ویروس را با قطعیت تشخیص داده و با شماره دسترسی LC۷۱۳۲۷۶ در بانک ژن جهانی ثبت گردید.   [۱] Raha Zist Padtan [۲] Nested PCR

کلیدواژه ها:

Koi herpesvirus disease ، Common carp ، Nested PCR ، Khuzestan Province ، بیماری کوی هرپس ویروس ، کپور معمولی ، Nested PCR ، استان خوزستان