ارزیابی فنوتیپی، تجزیه ارتباطی و حاشیه نویسی ژن های مرتبط با پژمردگی برگ گندم نان (.Triticum aestivum L) در مرحله گیاهچه ای در شرایط تنش خشکی

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 170

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AGRO-24-3_004

تاریخ نمایه سازی: 28 آذر 1401

چکیده مقاله:

غربالگری سریع ژرم پلاسم گیاهی در مراحل اولیه رشد و شناسایی مبنای ژنتیکی شاخص پژمردگی برگ گندم در مرحله گیاهچه­ای برای برنامه­های اصلاحی گندم ضروری است. در تحقیق حاضر، تعداد ۲۹۰ ژنوتیپ گندم نان ایرانی شامل ۹۰ رقم زراعی و ۲۰۰ توده بومی در سال ۱۴۰۰ در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در شرایط تنش خشکی در مرحله گیاهچه­ای از نظر شاخص پژمردگی برگ مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که بین ژنوتیپ­های مورد مطالعه به لحاظ میزان پژمردگی برگ تنوع وجود داشت و توده­های بومی به­طور معنی­داری، (حدود ۱۲ درصد) از نمره پژمردگی بیشتری نسبت به ارقام زراعی برخوردار بودند که این موضوع می­تواند نتیجه مستقیم یا غیرمستقیم گزینش باشد. از نظر شاخص پژمردگی برگ حدود نه درصد از ارقام زراعی و سه درصد از توده­های بومی در گروه متحمل به تنش خشکی قرار گرفتند. تجزیه ارتباطی با دو روش GLM و MLM تقریبا نتایج یکسانی داشت. کروموزم­های ۳B، ۲A، ۷B، ۱A، ۳A، ۴B، ۵B، ۶A و ۶B به­ترتیب بیشترین تعداد ارتباط نشانگر با شاخص پژمردگی برگ را در کل جمعیت داشتند که تنوع فنوتیپی صفت را از ۶ الی ۲۰ درصد توجیه می­کردند. حاشیه­نویسی نشانگرهای معنی­دار، تاییدکننده نتایج تجزیه GWAS بود و نشان داده شد که تعداد پنج نشانگر روی کروموزوم­های ۱A، ۲A، ۳A و ۷B با ژن هایی که در تحمل گیاه گندم به تنش خشکی نقش دارند، هم­ردیفی داشتند. جزء جدایی ناپذیر غشا بودن، فسفوریلاسیون پروتئین­ها، فعالیت آنزیم های متیل ترانسفراز و اتصال یون روی (Zn۲+) بخشی از کارکردهای مولکولی و فرآیندهای زیستی ژن­های یاد شده بودند. یافته­های تحقیق حاضر، بینشی عمیق در رابطه با پژمردگی برگ گندم­های نان ایرانی در شرایط تنش خشکی ارائه می دهد که می­توان از آن در برنامه­های گزینشی آتی گندم نان استفاده کرد.  

کلیدواژه ها:

Bread wheat Chromosome ، Genome wide association study ، Leaf wilting index ، and Molecular markers ، تجزیه ارتباطی در سطح ژنوم ، شاخص پژمردگی برگ ، کروموزوم ، گندم نان و نشانگرهای مولکولی

نویسندگان

حسین عبدی

Urmia University, Urmia, Iran

هادی علی پور

Urmia University, Urmia, Iran

ایرج برنوسی

Urmia University, Urmia, Iran

جعفر جعفر زاده

Dryland Agricultural Research Institute (DARI), Agriculture Research, Education and Extension Organization (AREEO), Maragheh, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Acuña‐Galindo, M. A., R. E. Mason, N. K. Subramanian and ...
  • Ahmed, A. A., E. A. Mohamed, M. Y. Hussein and ...
  • Ali, Q., S. Ali, N. Iqbal, M. T. Javed, M. ...
  • Alipour, H. ۲۰۱۶. Association mapping of the main agronomic traits ...
  • Alipour, H., M. R. Bihamta, V. Mohammadi, S. A. Peyghambari, ...
  • Alipour, H., H. Abdi, Y. Rahimi and M. R. Bihamta. ...
  • Alipour, H., G. Bai, G. Zhang, M. R. Bihamta, V. ...
  • Alipour, H., H. Abdi and M. R. Bihamta. ۲۰۲۱a. Assessment ...
  • Alipour, H., H. Abdi, Y. Rahimi and M. R. Bihamta. ...
  • Alqudah, A. M., J. K. Haile, D. Z. Alomari, C. ...
  • Ballesta, P., F. Mora and A. Del Pozo. ۲۰۲۰. Association ...
  • Blum, A. ۲۰۱۸. Plant Breeding for Stress Environments (۱st Ed.). ...
  • Bradbury, P.J., Z. Zhang, D.E. Kroon, T. M. Casstevens, Y. ...
  • Cai, X., Y. Sun, Y. Zhao, L. Damerow, P.S. Lammers, ...
  • Dodig, D., M. Zorić, M. Jović, V. Kandić, R. Stanisavljević ...
  • Jung, J. H., M. J. Hong, D.Y. Kim, J. Y. ...
  • Kim, M., C. Lee, S. Hong, S. L. Kim, J. ...
  • Kirigwi, F. M., M. Van Ginkel, G. Brown-Guedira, B. S. ...
  • Lipka, A. E., F. Tian, Q. Wang, J. Peiffer, M. ...
  • Luo, F., X. Deng, Y. Liu and Y. Yan. ۲۰۱۸. ...
  • Maccaferri, M., M. C. Sanguineti, A. Demontis, A. El-Ahmed, L. ...
  • Naghavi, M. R., M. Moghaddam. M. Toorchi and M. R. ...
  • Praba, M. L., J. E. Cairns, R. C. Babu and ...
  • Pungulani, L. L., J. P. Millner, W. M. Williams and ...
  • Rahimi, Y., M. R. Bihamta, A. Taleie, H. Alipour and ...
  • Rahimi, Y., M. R. Bihamta, A. Taleie, H. Alipour and ...
  • Richards, R. A. ۲۰۲۲. Drought. In: Reynolds, M.P., H.J. Braun ...
  • Sabiel, S. A., S. Huang, X. Hu, X. Ren, C. ...
  • Sallam, A., A. M. Mourad, W. Hussain and P. Stephen ...
  • Sallam, A., S. Eltaher, A. M. Alqudah, V. Belamkar and ...
  • Sayed, M. A., H. Schumann, K. Pillen, A. A. Naz ...
  • Sun, C., F. Zhang, X. Yan, X. Zhang, Z. Dong, ...
  • Tibbs Cortes, L., Z. Zhang and J. Yu. ۲۰۲۱. Status ...
  • Umair Hassan, M., M. Aamer, M. Umer Chattha, T. Haiying, ...
  • Yan, X., L. Zhao, Y. Ren, Z. Dong, D. Cui ...
  • Zhao, Z., G. J. Rebetzke, B. Zheng, S. C. Chapman ...
  • Zhou, J., J. Zhou, H. Ye, M. L. Ali, H. ...
  • Zuffo, L. T., R. O. DeLima and T. Lübberstedt. ۲۰۲۲. ...
  • Acuña‐Galindo, M.A., R.E. Mason, N.K. Subramanian and D.B. Hays. ۲۰۱۵. ...
  • Ahmed, A.A., E.A. Mohamed, M.Y. Hussein and A. Sallam. ۲۰۲۱. ...
  • Ali, Q., S. Ali, N. Iqbal, M.T. Javed, M. Rizwan, ...
  • Alipour, H. ۲۰۱۶. Association mapping of the main agronomic traits ...
  • Alipour, H., M.R. Bihamta, V. Mohammadi, S.A. Peyghambari, G. Bai ...
  • Alipour, H., H. Abdi, Y. Rahimi and M.R. Bihamta. ۲۰۱۹ ...
  • Alipour, H., G. Bai, G. Zhang, M.R. Bihamta, V. Mohammadi ...
  • Alipour, H., H. Abdi and M.R. Bihamta. ۲۰۲۱ a. Assessment ...
  • Alipour, H., H. Abdi, Y. Rahimi and M.R. Bihamta. ۲۰۲۱ ...
  • Alqudah, A.M., J.K. Haile, D.Z. Alomari, C.J. Pozniak, B. Kobiljski ...
  • Ballesta, P., F. Mora and A. Del Pozo. ۲۰۲۰. Association ...
  • Blum, A. ۲۰۱۸. Plant breeding for stress environments, ۱st ed.; ...
  • Bradbury, P.J., Z. Zhang, D.E. Kroon, T.M. Casstevens, Y. Ramdoss ...
  • Cai, X., Y. Sun, Y. Zhao, L. Damerow, P.S. Lammers, ...
  • Dodig, D., M. Zorić, M. Jović, V. Kandić, R. Stanisavljević ...
  • Jung, J.H., M.J. Hong, D.Y. Kim, J.Y. Kim, H.Y. Heo, ...
  • Kim, M., C. Lee, S. Hong, S.L. Kim, J.H. Baek ...
  • Kirigwi, F.M., M. Van Ginkel, G. Brown-Guedira, B.S. Gill, G.M. ...
  • Lipka, A.E., F. Tian, Q. Wang, J. Peiffer, M. Li, ...
  • Luo, F., X. Deng, Y. Liu and Y. Yan. ۲۰۱۸. ...
  • Maccaferri, M., M.C. Sanguineti, A. Demontis, A. El-Ahmed, L. Garcia ...
  • Naghavi, M.R., M. Moghaddam. M. Toorchi and M.R. Shakiba. ۲۰۱۶. ...
  • Praba, M.L., J.E. Cairns, R.C. Babu and H.R. Lafitte. ۲۰۰۹. ...
  • Pungulani, L.L., J.P. Millner, W.M. Williams and M. Banda. ۲۰۱۳. ...
  • Rahimi, Y., M.R. Bihamta, A. Taleei, H. Alipour and P.K. ...
  • Rahimi, Y., M.R. Bihamta, A. Taleei, H. Alipour and P.K. ...
  • Richards, R.A. ۲۰۲۲. Drought. In Wheat Improvement. Springer, Cham, ۴۱۷-۴۳۲ ...
  • Sabiel, S.A., S. Huang, X. Hu, X. Ren, C. Fu, ...
  • Sallam, A., A.M. Mourad, W. Hussain and P. Stephen Baenziger. ...
  • Sallam, A., S. Eltaher, A.M. Alqudah, V. Belamkar and P.S. ...
  • Sayed, M.A., H. Schumann, K. Pillen, A.A. Naz and J. ...
  • Sun, C., F. Zhang, X. Yan, X. Zhang, Z. Dong, ...
  • Tibbs Cortes, L., Z. Zhang and J. Yu. ۲۰۲۱. Status ...
  • Umair Hassan, M., M. Aamer, M. Umer Chattha, T. Haiying, ...
  • Yan, X., L. Zhao, Y. Ren, Z. Dong, D. Cui ...
  • Zhao, Z., G.J. Rebetzke, B. Zheng, S.C. Chapman and E. ...
  • Zhou, J., J. Zhou, H. Ye, M.L. Ali, H.T. Nguyen ...
  • Zuffo, L.T., R.O. DeLima and T. Lübberstedt. ۲۰۲۲. Combining data ...
  • نمایش کامل مراجع