سالیتون های توپولوژیک در مولکول DNA با پتانسیل اصلاح یافته

مولکول DNA نه تنها از دیدگاه زیست شناسان دارای اهمیت فراوان زیستی است بلکه مورد جالبی برای مطالعه فیزیکدان ها نیز می باشد. حالت های باز ( Open state: حالتی که در آن پایه های دو رشته از یکدیگر جدا شده و باعث باز شدن بخشی از دو رشته از هم می شوند.) در مارپیچ دوتایی مولکول DNAقابل مدلسازی با سالیتون های توپولوژیک هستند. از آنجایی که این مولکول دارای طول بسیار بلند (در حدود متر) و عرض بسیار کوچک (در حدود نانو متر) است سالیتون های ایجاد شده قادر خواهند بود در امتداد رشته DNA حرکت کنند. دراین مقاله با پیشنهاد یک جمله اصلاحی در پتانسیل برهم کنش میان دو رشته این مولکول در مدل استاندارد یاکوشویچ، پس از تشکیل هامیلتونی به بررسی رابطه پاشندگی وحل عددی معادلات با معرفی شیوه ای نوین پرداخته ایم و پاسخ های حاصل از جمله اصلاحی و انرژی سالیتون های پاسخ را با پاسخ های پیشین مقایسه نموده ایم.

کلیدواژه ها:

دینامیک مولکول DNA ، فیزیک غیرخطی مولکولDNA ، سالیتون های توپولوژیک