براورد میزان هم خونی در گاو هلشتاین ایران با استفاده از تراشه های متراکم نشانگری

این مطالعه با هدف برآورد میزان هم خونی درجمعیت گاو هلشتاین ایرانی بر پایۀ استفاده از نشانگرهای متراکم چند شکل تک نوکلئوتیدی انجام گرفت. بدین منظور بعد از کنترل کیفیت داده های حاصل از تعیین ژنوتیپ SNP ها، 22.925 نشانگر SNP جهت محاسبه اندازه موثر جمعیت قرار گرفت. با در نظرگرفتن 150 رأس دام ماده که برای نمونه گیری و تعیین ژنوتیپ انتخاب شده بودند، تعداد 2 رأس از این دام ها نیز به دلیل ژنوتیپ کاملاً همسان با لحاظ کردن تمام موارد محتمل و آزمون مجدد از منبع اطلاعاتی حذف گردیدند. در نهایت، اطلاعات 22/925 نشانگر و 148 رأس دام مد نظر قرارگرفت. در مطالعه حاضر ضریب هم خونی به روش ROH کمتر براورد شد که نشان می دهد ROH کمتر تحت تاثیر فراوانی اللی قرار می گیرد.

کلیدواژه ها:

میزان هم خونی ، تراشه های متراکم نشانگری ، ایمپیوتیشن ، هلشتاین