شناسایی جایگاه های ژنومی کنترل کننده صفات فنولوژیک و مورفولوژیک در ژنوتیپ های جو (.Hordeum vulgare L) با استفاده از تجزیه ارتباطی

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 351

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AGRO-22-4_001

تاریخ نمایه سازی: 27 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

نقشه­یابی ارتباطی روش مناسبی جهت شناسایی جایگاه صفات کمی بر اساس عدم تعادل لینکاژی است که در تشریح صفات پیچیده ژنتیکی کارآیی بالایی دارد. این روش ابزار قدرتمندی جهت تشریح صفات پیچیده زراعی و شناسایی آلل­های موثر در صفت مورد نظر محسوب می شود. در این تحقیق، نقشه­یابی ارتباطی کل ژنوم در ۱۴۸ ژنوتیپ جمعیت جو بهاره انجام شد. ارزیابی فنوتیپی در قالب طرح آلفا لاتیس در دو تکرار در دو سال زراعی (۹۴-۱۳۹۳ و ۹۵-۱۳۹۴) در ایستگاه تحقیقات کشاورزی زهک انجام شد و صفات روز تا گرده­افشانی، روز تا رسیدگی، طول دوره پر شدن دانه، طول برگ پرچم، عرض برگ پرچم، تعداد دانه در سنبله اصلی، وزن هزاردانه و عملکرد دانه اندازه گیری شدند. تجزیه ارتباطی بین نشانگرها و داده های فنوتیپی، براساس مدل خطی مخلوط همراه با  ماتریس Q و ماتریس K انجام شد و در مجموع ۲۸ جایگاه ژنومی (QTL) در ارتباط با صفات مورد ارزیابی شناسایی شدند. برای صفت روز تا گرده­افشانی، یک جایگاه ژنومی پایدار روی کروموزوم ۵H (۷۶/۷۴ سانتی مورگان) شناسایی شد. سه جایگاه ژنومی پایدار روی کروموزوم­های ۴H (۰۸/۱۲۵ و ۶۴/۱۲۰ سانتی مورگان) و ۵H (۷۶/۷۴ سانتی مورگان) برای صفت دوره پر شدن دانه شناسایی گردید. یک QTL روی کروموزوم ۲H (۸۷/۱۰ سانتی مورگان) در ارتباط با صفات روز تا گرده­افشانی، طول دوره پر شدن دانه و وزن هزار دانه شناسایی شد. یک QTL روی کروموزوم ۴H (۰۸/۱۲۵ سانتی مورگان) با صفات روز تا گرده­افشانی، دوره پر شدن دانه، طول برگ پرچم و وزن هزاردانه در ارتباط بود. مکان های مشترک برای صفات یاد شده احتمالا ناشی از اثر پلیوتروپی و یا پیوستگی بین مکان های ژنی کنترل کننده صفات مورد نظر بوده و فرضیه هم­مکانی یا چند اثره بودن QTL­ها را تقویت می کند.

کلیدواژه ها:

Association mapping ، Barley ، Chromosome ، Genomic loci and Thousand grain weight. ، جایگاه ژنومی ، جو ، کروموزوم ، وزن هزار دانه و نقشه یابی ارتباطی

نویسندگان

زهرا کوچک پور

Former PhD Student, University of Zabol, Zabol, Iran

محمود سلوکی

Professor, University of Zabol, Zabol, Iran

براتعی فاخری

Professor, University of Zabol, Zabol, Iran

رضا اقنوم

Assistant Prof., Khorasan Razavi Agricultural and Natural Resources Research and Education Center, AREEO, Mashhad, Iran

نفیسه مهدی نژاد

Assistant Prof., University of Zabol, Zabol, Iran

میترا جباری

Assistant Prof., Higher Education Complex of Saravan. Saravan, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abou-Elwafa, S.F. ۲۰۱۶a. Association mapping for drought tolerance in barley ...
  • Abou-Elwafa, S.F. ۲۰۱۶b. Association mapping for yield and yield-contributing traits ...
  • Aghnoum, R., T.C. Marcel, A. Johrde, N. Pecchioni, P. Schweizer ...
  • Alqudah, A.M and T. Schnurbusch. ۲۰۱۷. Heading date is not ...
  • Bradbury, P.J., Z. Zhang, D.E. Kroon, T.M. Casstevens, Y. Ramdoss ...
  • Buckler, E.S. and J.M. Thornsberry. ۲۰۰۲. Plant molecular diversity and ...
  • Chen, G., T. Krugman, T. Fahima, K. Chen, Y. Hu, ...
  • Chen, C.X., S.C. Li, S.Q. Wang, H.N. Liu, Q.M. Deng, ...
  • Diab, A.A., B. Teulat, D. This, N.Z. Ozturk, D. Benscher ...
  • El-Mohsen, A.A.A. ۲۰۱۳. Correlation and regression analysis in barley. World ...
  • Evanno, G., S. Regnaut and J. Goudet. ۲۰۰۵. Detecting the ...
  • Gordon, D. and S.J. Finch. ۲۰۰۵. Factors affecting statistical power ...
  • Jabbari, M., B.A. Fakheri, R. Aghnoum, N. Mahdi Nezhad, and ...
  • Kraakman, A.T.W., R.E. Niks, P.M.M.M. Van den Berg, P. Stam ...
  • Kraakman, A.T.W., F. Martinez, B. Mussiraliev, F.A. Van Eeuwijk and ...
  • Kushwaha, U.K.S., V. Mangal, A.K. Bairwa, S. Adhikari, T. Ahmed, ...
  • Locatelli, A., A. Cuesta-Marcos, L. Gutierrez, P.M. Heyes, K.P. Smith ...
  • Marathi, B., S. Guleria, T. Mohapatra, R. Parsad, N. Mariappan, ...
  • Mueller, J.C. ۲۰۰۴. Linkage disequilibrium for different scales and applications. ...
  • Pasam, R.K., R. Sharma, M. Malosetti, F.A. Van Eeuwijk, G. ...
  • Pritchard, J.K., M. Stephens and P. Donnelly. ۲۰۰۰. Inference of ...
  • Ramsay L., M. Macaulay, S. Degli-Ivanissevich, K. MacLean, L. Cardle, ...
  • Ramsay, L., J. Comadran, A. Druka, D.F. Marshall, W.T. Thomas, ...
  • Rustgi, S., M.N. Shafaqat, N. Kumar, P.S. Baenziger, M.L. Ali, ...
  • Spiertz, J.H.J., B.A. Tenhag and L.J.P. Kupers. ۱۹۷۱. Relation between ...
  • Sun, D., W. Ren, G. Sun and J. Peng. ۲۰۱۱. ...
  • Wang, J., G. Sun, X. Ren, C. Li, L. Liu, ...
  • Xu, X., R. Sharma, A. Tondelli, J. Russell, J. Comadran, ...
  • Xue, D.W., M.C. Chen, M.X. Zhou, S. Chen, Y. Mao ...
  • Yan, J., M. Warburton and J. Crouch. ۲۰۱۱. Association mapping ...
  • Abou-Elwafa, S.F. ۲۰۱۶a. Association mapping for drought tolerance in barley ...
  • Abou-Elwafa, S.F. ۲۰۱۶b. Association mapping for yield and yield-contributing traits ...
  • Aghnoum, R., T.C. Marcel, A. Johrde, N. Pecchioni, P. Schweizer ...
  • Alqudah, A.M and T. Schnurbusch. ۲۰۱۷. Heading date is not ...
  • Bradbury, P.J., Z. Zhang, D.E. Kroon, T.M. Casstevens, Y. Ramdoss ...
  • Buckler, E.S. and J.M. Thornsberry. ۲۰۰۲. Plant molecular diversity and ...
  • Chen, G., T. Krugman, T. Fahima, K. Chen, Y. Hu, ...
  • Chen, C.X., S.C. Li, S.Q. Wang, H.N. Liu, Q.M. Deng, ...
  • Diab, A.A., B. Teulat, D. This, N.Z. Ozturk, D. Benscher ...
  • El-Mohsen, A.A.A. ۲۰۱۳. Correlation and regression analysis in barley. World ...
  • Evanno, G., S. Regnaut and J. Goudet. ۲۰۰۵. Detecting the ...
  • Gordon, D. and S.J. Finch. ۲۰۰۵. Factors affecting statistical power ...
  • Jabbari, M., B.A. Fakheri, R. Aghnoum, N. Mahdi Nezhad, and ...
  • Kraakman, A.T.W., R.E. Niks, P.M.M.M. Van den Berg, P. Stam ...
  • Kraakman, A.T.W., F. Martinez, B. Mussiraliev, F.A. Van Eeuwijk and ...
  • Kushwaha, U.K.S., V. Mangal, A.K. Bairwa, S. Adhikari, T. Ahmed, ...
  • Locatelli, A., A. Cuesta-Marcos, L. Gutierrez, P.M. Heyes, K.P. Smith ...
  • Marathi, B., S. Guleria, T. Mohapatra, R. Parsad, N. Mariappan, ...
  • Mueller, J.C. ۲۰۰۴. Linkage disequilibrium for different scales and applications. ...
  • Pasam, R.K., R. Sharma, M. Malosetti, F.A. Van Eeuwijk, G. ...
  • Pritchard, J.K., M. Stephens and P. Donnelly. ۲۰۰۰. Inference of ...
  • Ramsay L., M. Macaulay, S. Degli-Ivanissevich, K. MacLean, L. Cardle, ...
  • Ramsay, L., J. Comadran, A. Druka, D.F. Marshall, W.T. Thomas, ...
  • Rustgi, S., M.N. Shafaqat, N. Kumar, P.S. Baenziger, M.L. Ali, ...
  • Spiertz, J.H.J., B.A. Tenhag and L.J.P. Kupers. ۱۹۷۱. Relation between ...
  • Sun, D., W. Ren, G. Sun and J. Peng. ۲۰۱۱. ...
  • Wang, J., G. Sun, X. Ren, C. Li, L. Liu, ...
  • Xu, X., R. Sharma, A. Tondelli, J. Russell, J. Comadran, ...
  • Xue, D.W., M.C. Chen, M.X. Zhou, S. Chen, Y. Mao ...
  • Yan, J., M. Warburton and J. Crouch. ۲۰۱۱. Association mapping ...
  • نمایش کامل مراجع