بررسی سطح بیان ژن های عامل سرطان لمفوما به کمک ارائه مدل دسته بند تقریبی فازی
محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی قم، دوره: 9، شماره: 10
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 110
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_MUQ-9-10_002
تاریخ نمایه سازی: 2 آبان 1401
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: سرطان یکی از دلایل عمده مرگ و میر در دنیای امروز است و به عنوان یکی از مهم ترین مشکلات سلامت جوامع محسوب می شود. اکثر روش های پیشنهادی جهت دسته بندی سرطان به کمک داده های بیان ژن مانند یک جعبه سیاه عمل کرده و قابلیت تفسیرپذیری زیستی ندارند. این مطالعه با هدف معرفی روشی بهینه با قابلیت تفسیر داده های بیان ژن انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه، روش ترکیبی پالایشی - پوششی برای انتخاب ویژگی زیرمجموعه ای از ژن های موثر در سرطان مورد استفاده قرار گرفت که این عمل باعث کاهش چشمگیر تعداد نمونه ها در مقایسه با تعداد ژن ها شد. همچنین در این مطالعه با ترکیب روش های خوشه بندی فازی، مجموعه های تقریبی و اعتبارسنجی K- دسته ای؛ به گسسته سازی داده ها، تولید و کاهش قوانین و ارزیابی نتایج پرداخته شد. براین اساس، روش جدیدی با قابلیت تفسیرپذیری زیستی و استخراج معانی از داده های بیان ژن معرفی گردید که این روش Fuzzy Rough set Classification نامیده شد. یافته ها: با استفاده از روش پالایشی – پوششی انتخاب ویژگی در ریزآرایه لمفوما، از میان ۴۰۲۹ ژن، ۶ ژن انتخاب شد. در روش دسته بندی تقریبی فازی جهت تولید یک مدل دسته بند با قابلیت تفسیر داده های بیان ژن، دو قانون تولید شده است. نتیجه گیری: در این روش با استفاده از توابع رتبه بندی، مهم ترین قوانین فازی انتخاب شد که علاوه بر قابلیت تولید یک مدل دسته بند کارآمد، قابلیت تفسیر داده های بیان ژن را ممکن می سازد. یکی دیگر از ویژگی های برجسته این روش، حل موفقیت آمیز مسئله عدم تناسب میان تعداد نمونه ها و ژن ها در ریزآرایه ها به روش پیشنهادی پالایشی - پوششی انتخاب ویژگی بوده است.
کلیدواژه ها:
Lymphoma ، Early detection of cancer ، Gen expression level ، Microarray analysis. ، لمفوما ، تشخیص اولیه سرطان ، سطح بیان ژن ، تحلیل میکروآرایه.
نویسندگان
زهرا روزبهانی
Faculty of Engineering & Technology, University of Qom
علی کتان فروش
Faculty of Mathematical Sciences, Shahid Beheshti University
منصور ابراهیمی
Department of Biology, University of Qom
منصوره یاری ایلی
Faculty of Engineering & Technology, University of Qom
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :