ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی ردپای انتخاب و هستی شناسی ژن در برخی نژاد های گوسفند اهلی و وحشی ایران

محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای علوم دامی ایران، دوره: 15، شماره: 4
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 79

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1875387

شناسه ملی سند علمی:

JR_JASR-15-4_008

تاریخ نمایه سازی: 14 دی 1402

چکیده مقاله:

در طی سالیان طولانی، حیوانات در معرض عوامل مختلفی مانند انتخاب طبیعی، رانش ژنتیکی و جهش­های متعدد قرار گرفته­اند، بنابراین چنین عواملی سبب تغییرات در بین و داخل گونه­ها شده است. از سویی دیگر امروزه نیاز به افزایش تولید سبب کاهش تنوع ژنتیکی گونه­ها بوده که نگرانی­های شدیدی را برای سیستم تولیدی حیوانات در سراسر جهان به وجود آورده است. هدف از انجام این تحقیق، شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب در گوسفندان اهلی در مقایسه با گوسفندان وحشی ایران و بررسی هستی شناسی ژن­های کاندید مرتبط با صفات اقتصادی می­باشد. در این تحقیق، داده­های دو گروه گوسفند اهلی (۱۰۶ راس) و وحشی (۸ راس) بومی ایران بعد از ویرایش و کنترل کیفیت با نرم افزارهای R و Plink مورد آنالیز قرار گرفتند و نتایج حاصل با استفاده از سرورهای آنلاین DAVID، GeneCards و UniProtKB تفسیر شدند. نتایج نهایی نشان دادند، ۹۵ منطقه ژنومی روی ۲۳ کروموزوم در گوسفند وحشی و اهلی با هم اختلاف داشتند و بیشترین اختلاف روی کروموزوم­های ۱۳ و ۷ بوده که به ترتیب با ژن­های ۱۴ و ۹ مرتبط می­باشند. بررسی مناطق ژنومی دارای اختلاف در دو نژاد نشان دادند که این مناطق با صفات کیفیت و کمیت گوشت، شیر، چربی، استخوان (با فراوانی بالاتر در گونه اهلی) و سیستم ایمنی و مقاومت به انگل (با فراوانی بالاتر در گونه اهلی) مرتبط می­باشند. برخی از ژن­های مهم شناسایی شده، شامل GABRB۱، GRM۳، HERC۱، HERC۳ و KCND۲ بودند. در بررسی هستی شناسی ژن­ها، مسیرهای زیستی شناسایی شده مربوط به کانال­های عبور یون ها از غشای سلولی، فرآیندهای تحریک عصبی عضلات، رشد مغز و مخچه، انتقال غشایی یون های غیر آلی بود. مشخص نمودن صفات مهم اقتصادی و مکان­یابی بخش هایی از ژنوم که در اثر انتخاب تغییر پیدا کرده­اند، می­تواند در برنامه­های اصلاح نژادی گوسفند در کشور مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مجید بی غم

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

محمدرضا نصیری

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

مهیار حیدرپور

دانشگاه علوم پزشکی هاروارد، دپارتمان پزشکی ، شهر بوستون، ایالت ماساچوست، آمریکا

علی جوادمنش

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Akey, J. M. (۲۰۰۹). Constructing genomic maps of positive selection ...
  • Al Kalaldeh, M., Gibson, J., Lee, S. H., Gondro, C., ...
  • Álvarez, I., Fernández, I., Traoré, A., Pérez-Pardal, L., Menéndez-Arias, N. ...
  • Bakhshalizadeh, S., Zerehdaran, S., & Javadmanesh, A. (۲۰۲۱). Meta-analysis of ...
  • Chen, Z.H., Xu, Y.X., Xie, X.L., Wang, D.F., Aguilar-Gómez, D., ...
  • Deng, X., Wang, D., Wang, S., Wang, H., & Zhou, ...
  • Dong, K., Yao, N., Pu, Y., He, X., Zhao, Q., ...
  • Dou, D., Shen, L., Zhou, J., Cao, Z., Luan, P., ...
  • Duarte, D.A.S., Fortes, M.R.S., de Souza Duarte, M., Guimarães, S.E., ...
  • Durinck, S., Spellman, P. T., Birney, E., & Huber, W. ...
  • Eydivandi, S., Sahana, G., Momen, M., Moradi, M. H., & ...
  • Forough Ameri, N., Asadi Fouzi, M., & Vasmeilizade Keshkoi, A., ...
  • Guan, D., Luo, N., Tan, X., Zhao, Z., Huang, Y., ...
  • Gunawan, A., Listyarini, K., Harahap, R.S., Jakaria, Roosita, K., Sumantri, ...
  • Guomundsdottir, O. O. (۲۰۱۵). Genome-wide association study of muscle traits ...
  • Hazard, D., Mace, T., Foulquie, D., Delval, E., Douls, S., ...
  • Jiao, D., Ji, K., Liu, H., Wang, W., Wu, X., ...
  • Krivoruchko, A. Y., Yatsyk, O. A., & Safaryan, E. Y. ...
  • Li, Z., He, X., Zhang, X., Zhang, J., Guo, X., ...
  • Liu, G., Liu, R., Tang, X., Cao, J., Zhao, S., ...
  • Mohammadi, F., Tahmoorespur, M., & Javadmanesh, A. (۲۰۱۹). Study of ...
  • Genome-wide association study and gene ontology for growth and wool characteristics in Zandi sheep [مقاله ژورنالی]
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K. G., ...
  • Mwacharo, J. M., Kim, E. S., Elbeltagy, A. R., Aboul-Naga, ...
  • Oldenbroek, K. (Ed.). (۲۰۰۷). Utilisation and Conservation of Farm Animal ...
  • Pickering, N. K. (۲۰۱۳). Genetics of flystrike, dagginess and associated ...
  • Kaveh Pishghadam, N., Malekian, M., & Adavodi, R. (۲۰۱۷). Genetic ...
  • Qanbari, S., Strom, T.M., Haberer, G., Weigend, S., Gheyas, A.A., ...
  • Qanbari, S., Pausch, H., Jansen, S., Somel, M., Strom, T.M., ...
  • Sabeti, P.C., Reich, D.E., Higgins, J.M., Levine, H.Z., Richter, D.J., ...
  • Sabeti, P.C., Varilly, P., Fry, B., Lohmueller, J., Hostetter, E., ...
  • Serranito, B., Cavalazzi, M., Vidal, P., Taurisson-Mouret, D., Ciani, E., ...
  • Suárez-Vega, A., Gutiérrez-Gil, B., & Arranz, J. J. (۲۰۱۶). Transcriptome ...
  • Sweet‐Jones, J., Yurchenko, A. A., Igoshin, A. V., Yudin, N. ...
  • Tao, L., He, X.Y., Wang, F.Y., Pan, L.X., Wang, X.Y., ...
  • Taheri,, Zerehdaran, S., & Javadmanesh, A. (۲۰۲۰). Investigating genetic diversity ...
  • Tsartsianidou, V., Sánchez-Molano, E., Kapsona, V.V., Basdagianni, Z., Chatziplis, D., ...
  • Upadhyay, M., Kunz, E., Sandoval‐Castellanos, E., Hauser, A., Krebs, S., ...
  • Wang, H., Zhang, L., Cao, J., Wu, M., Ma, X., ...
  • Weir, B. S., & Cockerham, C. C. (۱۹۸۴). Estimating F-statistics ...
  • Wiener, P., Robert, C., Ahbara, A., Salavati, M., Abebe, A., ...
  • Yang, J.I., Li, W.R., Lv, F.H., He, S.G., Tian, S.L., ...
  • Zeraatpisheh, Y., Zerehdaran, S., & Javadmanesh, A. (۲۰۲۲). Investigation of ...
    • نمایش کامل مراجع