Comparison of predicted protein sequences of the omega-۳ fatty acid desaturase gene family in some of the oil seed crops
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 56
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JPMB-11-1_003
تاریخ نمایه سازی: 17 بهمن 1402
چکیده مقاله:
The aim of this study was to conduct a comparative analysis of protein-predicted sequences within the omega-۳ fatty acid desaturase (FAD) gene family across various oilseed crops, such as cotton, soybean, rapeseed, and corn. Twenty-five Omega-۳ FAD genes were distinguished by the removal of similar sequences. Phylogenetic analysis of the Omega-۳ FAD gene family was detected. Omega-۳ FAD gene information, and physical parameters including the number of amino acids, chromosome locations, exon count and etc. were obtained. The results showed that the average length of the proteins encoded by the omega-۳ fatty acid desaturase proteins was ۳۸۸.۵۸ amino acid. The molecular weights of these proteins ranged from ۲۲.۲ to ۵۱.۳ kDa. The phylogenetic tree divided the omega-۳ FAD proteins into five clades. Clade ۲ comprises the smallest number of omega-۳ fatty acid desaturase gene members, whereas clade ۱ encompasses the highest number of members. We identified five pairs of orthologous genes among the omega-۳ FAD genes and identified a total of twenty distinct conserved motifs. Four of these motifs were associated with encoding the FAD domain, while an additional four were related to the DUF۳۴۷۴ domain. Undoubtedly, characterizing these FADs could offer valuable candidate genes for enhancing new oilseed varieties.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Ammar Afkhami Ghadi
Department of Genetic Engineering and Plant Breeding, Imam Khomeini International University, Qazvin, Iran
Seyyed Jaber Hosseini
Department of Agronomy, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
Ali Ghanbari
Department of Plant Production Engineering and Genetics, Zanjan University, Zanjan, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :