بررسی بیوانفورماتیکی عملکرد ژن FT در گیاه توت فرنگی

مهم ترین تغییر نموی در چرخه زندگی گیاهان شروع گلدهی می باشد. ژن Flowering Locus T یا FT(JN172098.1 accession number) یک پروتئین اتصال فسفاتیدیل اتانول آمین می باشد، که در شرایط طول روز بلند تحت تاثیر ژن CO در برگ ها فعال شده و پس از انتقال به مریستم انتهایی نقش کلیدی در تولید جوانه گل بازی می کند. انتقال این ژن به گیاهان باعث تسریع گلدهی شده است، بنابراین بررسی پروموتر این ژن با مقایسه Cis-element های موجود، جهت بالا بردن آگاهی و نحوه عملکرد آن حائز اهمیت می باشد. با بدست آوردن CDS ژن FT از NCBI حدود 1500 جفت باز از ناحیه پروموتری این ژن از سایت Phytozome گرفته شده و سپس آنالیز پروموتر با استفاده از دوسایت Plant CARE و PLACE انجام شد. نتایج نشان داد که حدود 14 مورد Cis-element پاسخ دهنده به نور و ریتم سیرکادین در این پروموتر مشاهده شد که بیانگر این است که به طور عمده عامل های رونویسی درگیر در مکانیسم های نوری به این نواحی Cis-element متصل می شوند. استفاده از این گونه پروموترها جهت استفاده در کاست های ژنی در بالا دست ژن های موثر در گلدهی، نه تنها در تسریع گلدهی بلکه در مطالعات فیزیولوژیک نیز حائز اهمیت می باشد.

کلیدواژه ها:

آنالیز پروموتر ، شبکه ژنی ، بیوانفورماتیک ، گلدهی ، FT