مطالعه شبکه ژنی مرتبط با ژن های NPR در گیاه آرابیدوپسیس تالیانا

ژن های خانواده NPR فعال کننده های رونویسی هستند که نقش مهمی در تنظیم مقاومت اکتسابی سیستمیک و تنظیم بیان تعداد زیادی از ژن های درگیر در پاسخ های دفاعی گیاه دارند. در این پژوهش، برای درک بهتر عملکرد سه ژن NPR3 ،NPR1 و NPR4 در گیاه آرابیدوپسیس، شبکه ژنی این سه ژن با کمک نرم افزار آنلاین String 9.1(http://string-db.org) ترسیم شد و عملکرد ژن های دارای میانکنش با این سه ژن با استفاده از پایگاه اطلاعاتی ATTED-II(http://atted.jp) و سایر منابع علمی، مورد مطالعه قرار گرفت. با توجه به مجموعه ژن هایی که با NPR3 و NPR4 دارای میانکنش بودند، می توان گفت که این دو ژن نیز مانند NPR1 در مسیر انتقال پیام سالیسیلیک اسید و بنابراین در القای مقاومت اکتسابی سیستمیک وابسته به سالیسیلیک اسید و تنظیم بیان ژن های PR نقش دارند. اما هنوز نمی توان به طور قطع گفت که نقش این دو ژن در القای مقاومت اکتسابی سیستمیک منفی است یا مثبت. چرا که از طرفی، گزارشات ضد و نقیضی درباره این مسئله وجود دارد و از طرف دیگر نتایج این پژوهش نشان داد که ژن هایی از دو دسته تنظیم کننده منفی (TGA2, WRKY33, NIMIN1 ) و تنظیم کننده مثبت پاسخ های دفاعی (XLG2, BCS1وLURP1, ANAC062 )،با دو ژن NPR3 و NPR4 میانکنش دارند. بنابراین، برای شاخت بهتر و وسیع تر از عملکرد دو ژن NPR3 و NPR4 ، مطالعه پارامترهای فیزیکی و شیمیایی و تعیین ساختار سوم و دمین های این پروتئین ها ضروری به نظر می رسد.

کلیدواژه ها:

آرابیدوپسیس ، شبکه ژنی ، ژن های خانواده NPR