بررسی مکانیسم های مولکولی حساسیت برنج به تنش شوری در سطح ترانسکریپتوم با استفاده از cDNA-AFLP

شوری یکی از فاکتورهای نامطلوب محیطی برای برنج است که رشد و باروری آن را محدود می نماید. تکنیک cDNA-AFLP ابزار بسیار مفیدی در راستای تجزیه و تحلیل تغییرات ایجاد شده در ترانسکریپتوم در اثر تنش شوری بوده و منابع ارزشمندی جهت مطالعات بیشتر و کاربردی در زمینه ی اصلاح و بهبود ژنتیکی گیاهان فراهم می آورد. در این مطالعه آنالیز cDNA-AFLP با هدف مقایسه ی پاسخ های ترانسکریپتوم در راستای آشکار نمودن مکانیسم های درگیر در حساسیت برگ گیاه برنج به تنش شوری در سطح بیان ژن با استفاده از دو ژنوتیپ مقاوم و حساس به شوری تحت تیمار کلرید سدیم در دو سطح 0 (شاهد) و 100 میلی مولار به کار گرفته شد. از میان 20 عدد EST جدا سازی شده با کاهش بیان، 15 عدد EST با طول میانگین 230 جفت باز در NCBI ثبت گردید که با توجه به عدم تاثیر تنش شوری بر بیان آن ها در رقم مقاوم، احتمالا کاهش بیان آن ها در نمونه های تحت تنش شوری به دلیل حساسیت گیاه و عدم توانایی آن در حفظ سطوح پایه ی بیان در شرایط تنش باشد. بعد از به دست آوردن همولوژی این توالی ها با توالی های موجود در پایگاه های داده مشخص گردید این ESTها به گروه های متفاوتی از خانواده های ژنی از جمله ژن های مرتبط با متابولیسم، سیگنالینگ سلولی، بیوسنتز پروتیین و اسیدهای آمینه و ... تعلق داشتند. امید بر آن است که نتایج این پژوهش در راستای اصلاح حساسیت بوته های برنج به تنش شوری و به حداقل رساندن افت این محصول زراعی در آینده مفید واقع شود

کلیدواژه ها:

برنج (Oryza sativa L.) ، ترانسکریپتوم ، تنش شوری ، cDNA-AFLP