شناسایی جدایه‌های تک اسپور هموکاریون و ارزیابی فاصله ژنتیکی آن‌ها با استفاده از نشانگر SSR در قارچ خوراکی دکمه‌ای سفید (Agaricus bisporus)

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 242

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-6-4_003

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

تلاقی درون گونه‌ای مهمترین روش اصلاحی در قارچ دکمه‌ای سفید برای بهبود نژادهای تجاری آن می‌باشد و این مستلزم در اختیار داشتن جدایه‌های هموکاریون برای تلاقی است. چرخه زندگی خاص این قارچ - هموتالیسم ثانویه - سبب شده تنها درصد کمی از بازیدیوسپورها به صورت هموکاریون باشند. تشخیص و شناسایی جدایه‌های هموکاریون‌ها از جدایه‌های هتروکاریون بزرگترین مشکل پیش روی اصلاح‌گران بوده است. تاکنون روش مطمئنی برای تشخیص این جدایه­ها گزارش نشده است. در این مطالعه از 10 نشانگر ریزماهواره (SSR) که 9 عدد از آن ها هر کدام نماینده یک گروه لینکاژی از نقشه ژنتیکی این قارچ بودند؛ همراه با آزمون میوه‌دهی برای تشخیص هموکاریون­ها استفاده شد. از 71 جدایه­ی مورد آزمون برخی همانند والد مادری که به عنوان شاهد در نظر گرفته شد دارای دو باند و برخی دیگر تنها حضور یکی از باندهای والدی را نشان دادند. بر اساس نوع ترکیب آللی، جدایه­ها در دو گروه کلی هتروآللیک و هموآللیک قرار گرفتند. از گروه هموآللیک، 23 جدایه که در تمامی جایگاه­های بررسی شده الگوی تک آللی را نشان دادند به عنوان جدایه هموکاریون در نظر گرفته شدند. مقایسه نتایج  حاصل از نشانگرهای SSR و آزمون میوه­دهی بر روی جدایه‌ها نشان داد نتایج حاصل از آزمون میوه­دهی در مقایسه با نتایج نشانگرهای SSR از اطمینان کمتری برخوردارند زیرا عدم میوه­دهی در جدایه­هایی که هتروکاریون بودن آن­ها  توسط نشانگر SSR مشخص شد، مشاهده گردید. تشابه ژنتیکی محاسبه شده بر اساس ماتریس فاصله ژنتیکی بین23 جدایه هموکاریون بین 3/0 تا 1 متغیر بود و این جدایه­ها در دندروگرام ترسیم شده به دو گروه کلی تقسیم شدند. نتایج نشان دادند می­توان با احتمالی بیش از 8/99 درصد نسبت به قطعیت هموکاریون بودن جدایه‌ها پس از اجرای آزمایش با 10 آغازگر SSR  استفاده شده، اظهار نظر کرد

کلیدواژه ها:

قارچ خوراکی دکمه‌ای سفید ، نشانگر ریزماهواره ، هموکاریون ، هتروکاریون ، هیبرید

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Barroso G, Sonnenberg AS, Van Griensven LJ, Labarere J (2000). ...
  • Benbouza H, Jacquemin JM, Baudoin JP, Mergeai G (2006). Optimization ...
  • Callac P, Hocquart S, Imbernon, M, Desmerger C, Olivier JM ...
  • Callac P, Imbernon M, Kerrigan RW, Olivier JM (1996). The ...
  • Castle AJ, Horgen PA, Anderson JB (1987). Restriction fragment length ...
  • Castle AJ, Horgen PA, Anderson JB (1988). Crosses among homokaryons ...
  • Dickhardt R (1985). Homokaryotization of Agaricus bitorquis (Quel) Sacc and ...
  • Dutech C, Enjalbert JR, Fournier E, Delmotte FO, Barres B, ...
  • Foulongne-Oriol M, Spataro C, Cathalot V, Monllor S. Savoie JM ...
  • Foulongne-Oriol M, Spataro C, Savoie JM (2009). Novel microsatellite markers ...
  • Fritsche G, Sonnenberg AS (1988). Mushroom strains, In: Van Griensven ...
  • Horgen PA, Anderson JB (1992). Biotechnology and edible mushroom, In: ...
  • Kavousi HR, Farsi M, Shahriari F   (2008). Comparison of random ...
  • Kerrigan RW, Royer JC, Baller LM, Kohli Y, Horgen PA, ...
  • Kerrigan RW, Baller LM, Horgen PA, Anderson JB (1992). Strategies ...
  • Kerrigan RW, Spear MC (1997). Method for production of high ...
  • Khush RS, Watch MP, Horgen PA (1995). Molecular strategy for ...
  • Khush RS, Becker E, Wach M (1992). DNA amplification polymorphisms ...
  • May B, Royse DJ (1982). Confirmation of crosses between lines ...
  • Mehta KB, Bhandal MS (1994). Genetic improvement in the white ...
  • Miller RE (1971). Evidence of sexuality in the cultivated mushroom ...
  • Miller RE, Kananen DL (1972). Bipolar sexuality in the mushroom. ...
  • Nazrul MI, Yin-Bing B (2010). ISSR as new markers for ...
  • Ramirez L, Mueza V, Alfonso M, Barrenechea B, Alfonso L, ...
  • Royse D, May R (1982). Use of isozyme variation to ...
  • Singer R, Harris B (1987). Mushroom and Truffles. Koeltz Scientific ...
  • Soltis Lab CTAB DNA extraction protocol (2002). The soltis lab, ...
  • Summerbell RC, Castle AJ, Horgen PA, Anderson JB (1989). Inheritance ...
  • Taylor J, Geiser DM, Burt A, Koufopanou V (1999). The ...
  • Varshney RK, Graner A, Sorrells ME (2005). Genic microsatellite markers ...
  • Zane L, Bargelloni L, Patarnello T (2002). Strategies for microsatellite ...
  • Zhang R, Hu D, Zhang J, Zuo X, Jiang R, ...
  • . 10: 273-275. ...
  • نمایش کامل مراجع