بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-۲۲۲-۳p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان

سابقه و هدف: لوسمی لنفوسیتی حاد (Acute lymphocytic leukemia) ALL، نوعی سرطان است که بر روی سلول های سفید خون تاثیر می گذارد. این بیماری به سرعت پیشرفت می کند و نیاز به درمان فوری دارد. لوسمی لنفوبلاستیک حاد، شایع ترین نوع لوسمی است که کودکان را تحت تاثیر قرار می دهد. در خلال این بیماری افزایش مولکول miR-۲۲۲-۳p مشاهده شده است. از روش ریزآرایه می توان برای بررسی اتصالات این miRNA و ژن های هدف استفاده کرد، که این مورد با محدودیت هایی روبه رو است. بر همین اساس، در این مطالعه، از روش های کامپیوتری و بیوانفورماتیکی توسط نرم افزارهای مختلف و اختصاصی استفاده شد. مواد و روش ها: ژن های هدف با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های Mirbase، TargetScan، NCBI و RNAhybrid مشخص شدند و بر اساس امتیازات به دست آمده، اهداف دارای بالاترین تمایل شناسایی شدند. یافته ها: یافته های این مطالعه نشان داد که ژن های CDH۴، AJAP۱، HNRNPA۰، UBN۱ و ZNF۶۱۸ به عنوان اهداف بالقوه با اختصاصیت بالاتری برای miR-۲۲۲-۳p می باشند. نتیجه گیری: دو عامل میزان انرژی آزاد منفی و تعداد جفت بازهای تشکیل شده بین miRNA و UTR-۳’ ژن های مختلف در انتخاب اهداف با اختصاصیت و تمایل بالاتر نقش دارند.

کلیدواژه ها:

miRNA ، Acute lymphocytic leukemia ، Bioinformatics ، miR-۲۲۲-۳p ، miRNA ، لوسمی لنفوبلاستیک حاد ، بیوانفورماتیک ، miR-۲۲۲-۳p