تشخیص ارقام گندم نان براساس انگشت نگاری DNA با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 109

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-15-2_010

تاریخ نمایه سازی: 8 مهر 1402

چکیده مقاله:

هدف: هدف از این پژوهش بررسی میزان تنوع ژنتیکی در ارقام گندم با استفاده از نشانگر RAPD و بررسی کارایی این نشانگر در تفکیک و گروه بندی ارقام و نیز تشخیص ارقام بر اساس انگشت نگاری  DNAمی باشد.مواد و روش ها: در این پژوهش ۴۲ رقم گندم نان بوسیله ۲۰ آغازگر RAPD مورد ارزیابی قرار گرفتند. بر اساس مشاهدات به صورت حضور نوار (۱) و عدم حضور (۰) اسکور بندی شده و ماتریس تشابه تشکیل شد.نتایج: براساس نتایج حاصل از آزمایش از ۱۳۲ نوار تولید شده ۸۸ نوار (۶۷/۶۶) درصد چند شکلی نشان دادند. سایز قطعات DNA چند شکل بین کمتر از ۱۰۰ جفت باز تا ۳۰۰۰ جفت باز می باشد و همچنین محدوده ی تولید نوارهای چند شکل ۲-۷ قطعه با متوسط ۴/۴ قطعه چند شکل، برای هر آغازگر است. RAPD۵۸ و RAPD۲۸ هر کدام با تولید هفت نوار چند شکل، بیشترین میزان چند شکلی را نشان دادند، RAPD۶۸ توانست ارقام امید و آزادی،OPB۰۸  ارقام چناب، سپاهان و سالیاسونز و TIBMBB۰۹ و ۱۷ TIBMBD رقم اترک را از سایر ارقام تشخیص دهد. نتایج حاصل از تجزیه کلاستر به روشUPGMA  میزان ضریب تشابه را بین ۷۴/۰ تا ۹۴/۰ محاسبه نمود و در خط برش ۷۹/۰درصد، ژنوتیپ های مورد مطالعه را در هفت گروه قرار داد. ارقام سیستان و گاسپارو دارای بیشترین شباهت بودند و ارقام اترک، ویریناک و آزادی در کلاسترهای مجزا جای گرفتند. همچنین تجزیه واریانس مولکولی AMOVA)) نشان داد که ۱درصد از واریانس بین جمعیت و ۹۹ درصد درون جمعیت می باشد.نتیجه گیری: نتایج حاصل از این پژوهش نشان می دهد که تنوع قابل توجهی در بین ارقام گندم نان مشاهده نشد، که می تواند به دلیل تعداد کم آغازگر و نیز ارقام مورد بررسی باشد. پیشنهاد می شود که از نشانگرهای دیگری همانند SSR که توان بیشتری در بروز تنوع ژنتیکی گندم را دارد استفاده نمود.

نویسندگان

بهنوش بهرامی

کارشناسی ارشد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

بهرام ملکی زنجانی

دانشیار، گروه تولید و ژنتیک گیاهی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

رقیه عظیم خانی

دانشجو دکتری اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • آقایی محمد جعفر، نقوی محمدرضا، امیدی منصور (۱۳۸۶) ارزیابی ژنوم ...
  • تقی زاده رضا (۱۳۹۰) بررسی تنوع ژنتیکی در دو گونه ...
  • دشتی حسین، نقوی محمدرضا، شاه نجات بوشهری علی اکبر، شیرانی ...
  • سید طباطبایی بدرالدین ابراهیم، شاه نجات بوشهری علی اکبر (۱۳۸۰) ...
  • شاه نجات بوشهری علی اکبر (۱۳۸۲) مطالعه تنوع ژنتیکی سویا ...
  • عبداللهی مندولکانی بابک، سید طباطبایی بدرالدین ابراهیم، شاه نجات بوشهری ...
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۹). مطالعه تنوع ...
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۷). تجزیه ژنتیکی ...
  • محمدی فر آمنه، فقیه ایمانی سید علی، محمدآبادی محمد رضا، ...
  • محمدی فر آمنه، محمدآبادی محمد رضا (۱۳۹۰). کاربرد نشانگرهای ریزماهواره ...
  • مرتضویان سید محمد مهدی، رامشینی حسینعلی، نقوی محمدرضا (۱۳۸۴) گروه ...
  • نظری مریم، عبدالشاهی روح اله (۱۳۹۳). بررسی تنوع ژنتیکی ارقام ...
  • ReferencesAbdollahi Mandoulakani B, Sayed Tabatabaei BE, Shahnejat Bushehry AA et ...
  • Aliyev R, Aliabbasov M, Mammadov A (۲۰۰۷) Genetic Identification of ...
  • Asif M, Rahman M, Zafar Y (۲۰۰۵) DNA fingerprinting studies ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (۲۰۰۸) Analysis Of The ...
  • Askari N, Baghizadeh A, MR Mohammadabadi (۲۰۱۰) Study of genetic ...
  • Benedetti D, Burchi G, Mercuri A et al. (۲۰۰۰) Random ...
  • Bousba R, Gueraiche S, Kanouni MR et al. (۲۰۲۰) Genotypic ...
  • Dashti H, Naghavi MR, Shahnejat Bushehry AA, Shirani H (۲۰۰۹) ...
  • Garcia MG, Ontivero M, Diaz Ricci JC, Castagnaro A (۲۰۰۲) ...
  • Ghasemi M, Baghizadeh A, Abadi MRM (۲۰۱۰) Determination of genetic ...
  • Gholamhoseini F, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M (۲۰۱۸) Polymorphism of ...
  • Gooki FG, Mohammadabadi M, Fozi MA, Soflaei M (۲۰۱۹) Association ...
  • Gupta PK, Varshney RK (۲۰۰۰) The Development and use of ...
  • Hallem SHM, Reham MA, Mohamed SMS (۲۰۰۹) Genetic analysis and ...
  • Kameswara Rao N (۲۰۰۴) Plant genetic resources advancing conservation and ...
  • Mohammadabadi MR (۲۰۱۷) Inter-Simple Sequence Repeat loci Associations with Predicted ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (۲۰۱۷) Using Inter Simple ...
  • Mohammadifar A, Faghih Imani SA, Mohammadabadi MR, Soflaei M (۲۰۱۴) ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi M (۲۰۱۸) Melanocortin-۳ receptor (MC۳R) gene association ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۱) Application of Microsatellite Markers for ...
  • Mortazavian SMM, Ramshini HA, Naghavi MR (۲۰۰۵) Grouping bread cultivars ...
  • Naghavi M, Mardi M, Ramshini H, Fazelinasab B (۲۰۰۴) Comparative ...
  • Nazari M, Abdolshahi R (۲۰۱۳) Evaluation of genetic diversity in ...
  • Ozkan H, Brandolini A, Pozzi C et al. (۲۰۰۵) A ...
  • Prabhu KV, Somers DS, Rakow G, Gugel RK (۱۹۹۸) Molecular ...
  • Rahmani M, Rahimi M, Abdolinasab M, Maleki M (۲۰۲۱) Evaluation ...
  • Rajaram S (۲۰۰۰) Adaptive traits related to terminal drought tolerance ...
  • Sayed Tabatabaei BE, Shahnejat Bushehry AA (۲۰۰۱) Evaluation of Genetic ...
  • Shahnejat Bushehry AA (۲۰۰۳) genetic diversity in soybean as determined ...
  • Simmons MP, Zang LB, Webb CT, Muller K (۲۰۰۷) A ...
  • Sofalian O, Chaparzadeh N, Dolati M (۲۰۰۹) Genetic diversity in ...
  • Tagheizadeh R (۲۰۱۱) genetic diversity in two species Agropyron cristatum ...
  • Thomas G, Mohapatra T, Rao AR, Sharma RP (۲۰۰۶) Distinguishing ...
  • نمایش کامل مراجع