پژوهشنامه مطالعات تطبیقی مذاهب فقهی از مقاله‌های تحقیقی از نوع تحلیلی اصیلی استقبال می‌کند که در آن به ارائه مطلب یا نظریه‌ای بدیع در زمینه‌های زیر پرداخته شده باشد:
تخصصی فقه و اجتهاد،
مبانی و اصول استنباط،
مبانی رجالی و حدیث‌شناسی،
تاریخ تطور مکاتب و مناهج اجتهادی،
روش‌ها و اصول استنباط،
افکار و اندیشه‌های اجتهادی فقهای بزرگ مذاهب فقهی
و سایر موضوعات مرتبط.